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外膜蛋白结构与分类课件
外膜蛋白
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目录
一.外膜蛋白的概念
二.外膜蛋白的结构及分类
三.外膜蛋白的功能
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一.外膜蛋白的概念
外膜蛋白(outer membrane proteins,OMP)是革兰氏阴性菌外膜中的主要结构成分,在细菌的生命活动中起着重要的作用。
外膜蛋白是一类非常独特但又非常重要的蛋白质,他们广泛的存在于原核生物的细胞外膜和真核生物的细胞器外膜中。
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二.外膜蛋白的结构及分类
都具有β-桶状结构,不同的外膜蛋白的β-桶由不同偶数个β-折叠片组成,从8个到22个不等。
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(二)分类
1.革兰阴性细菌的外膜蛋白按其在细胞中的拷贝数分为主要外膜蛋白和次要外膜蛋白
主要外膜蛋白在细胞内表达的拷贝数一般为lx105~2x105,包括外膜A蛋白(OmPA)、脂蛋白(Lipoprotein,LPP)和微孔蛋白(Porins)
(1)外膜A蛋白又称热修饰蛋白或跨膜蛋白,在外膜中含量较多,分子量为34~36kDa,富含β-片层结构。OmPA位于细菌染色体图谱21.5min处,该基因序列在不同菌种间具有高度保守性。
大肠杆菌在性导转染时候平均需要100分钟时间,这样按顺序把E.coli的基因分成1~100。
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OMPA
OMPF
FhuA
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(2)微孔蛋白又称基质蛋白或透道蛋白,由分子量为35-45kDa的三个相同亚单位构成三聚体结构,同OmpA一样,微孔蛋白富含β-片层结构,但不具有热修饰性,在作用温度小于85℃时,能抵抗SDS的灭活作用。
微孔蛋白按其运输物质种类不同又可以分为三类:第一类为普通孔蛋白(如OmPC和ompF),形成亲水性孔道,允许非特异性水溶性物质通过;第二类微孔蛋白包括LamB微孔蛋白、Ph0E微孔蛋白等,能特异性摄取小分子物质,如LamB参与麦芽糖的摄取,Ph0E则与磷脂酞化合物的摄取有关;第三类微孔蛋白能摄取介质中含量较低的大分子物质,如维生素B12、铁元素和含铁复合物,此外,大多数微孔蛋白还是噬菌体和大肠菌素的受体
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(3)脂蛋白是外膜中含量最多的蛋白质,由58个氨基酸组成,分子量约为7.2kDa,脂蛋白中1/3为结合脂蛋白,通过C端赖氨酸与肤聚糖层的胞壁酸共价交联,其余2/3为游离脂蛋白,脂蛋白具有高度α螺旋结构,其前体蛋白含有一个由20个氨基酸组成的信号肤,在脂蛋白分泌和易位到细菌外膜时信号肤即行脱落,脂蛋白不暴露于细胞表面,脂蛋白分子间交联形成寡聚体,并通过3个脂肪酸与外膜疏水结合,因此它不具有作为噬菌体受体和大肠菌素受体的功能
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次要外膜蛋白有20多种,其在细胞内的拷贝数为1x103~1x104。
但Omp的数量及种类随着不同菌株及不同培养条件而有所变化,如E.coli在富含麦芽糖培养基中培养时,lamB蛋白为主要蛋白,而当细菌在无铁条件下培养时,FepA蛋白则成为主要蛋白。
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2.按其存在位置与分离难易度不同分为膜内在蛋白和膜周边蛋白
膜内在蛋白约占外膜蛋白的70~80%,因其部分或全部镶嵌于脂质双层中,需使用剧烈条件才能把
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