核DNA锚定标记的筛选和其在劳亚兽总目系统发育基因组学中的应用.pdf

I了盔I曩了；，j，{ 摘要 摘 要 本论文共包括三个部分： 兽总目(Laurasiatheria)内系统发育关系的不确定性。 2．介绍了“直系同源基因，以及前人筛选系统发育基因组学新标记的一些方法， 分析了这些方法的优点和不足之处。然后提出了哺乳动物直系同源标记数据 Mammalian 库(Orthologous 因组学分析提供大量可用的标记。 3．从OrthoMaM中获得了447个锚定标记，并且对每个标记设计引物。其中122 对引物能够在劳亚兽总目的19个代表种中通过PCR有效扩增出来。进而随 机选取了8个标记来测序进行系统发育关系和进化速率分析。单个基因的基 因树在一定程度上解决了问题，但是基因树的拓扑结构相互冲突。用 组群和真盲缺目(Eulipotyphla)组成，并且鲸偶蹄目的单系性被很高的自展 qualitative 子系统学研究相吻合。另外本研究还揭示了谱系之间的进化速率的差异。刺 猬(真盲缺目)的同义突变是鲸偶蹄目和Pegasoferae组群的六倍，刺猬的枝 具有更快的分子钟。同时本研究还暗示了同义和非同义替代是由不同的生活 史特征决定的。 关键词：系统发育基因组学，标记，直系同源标记数据库(OrthoMaM)，劳亚 兽总目 Abstract three includes Thisthesis chapters： within andthe relationships 1．Introduced ambiguousphylogenetic phylogenomics Laurasiatheria· Superorder of new somemethods described developing 2．Introduced’，orthologousgene”，then the studiesand outsome markersfor in previous pointed phylogenomics to amethod we develop ofthem．Then and presented disadvantages advantages suchas ofdatabase withtheoccurrence newmarkers markers an to numerous