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9.蛋白质生物合成
第9章
蛋白质的生物合成 ; 蛋白质的生物合成(protein biosynthesis)也就是通常所说的翻译,通过翻译,核酸分子的4种核苷酸编码的基因语言就会被准确转变成由20余种标准氨基酸编码的蛋白质语言。
蛋白质的生物合成在细胞代谢中占有十分重要的地位,以大肠杆菌为例,蛋白质的含量占到了细胞干重的50%,其种类超过3000种,在细胞周期的20min内合成如此之多的蛋白质,速度是非常惊人的。同时这个过程也是非常复杂的,几乎涉及细胞内所有种类的RNA分子和上百种的蛋白质因子才能正常运转,这些分子组成了一个高效而精确的翻译机器。本章将主要介绍参与蛋白质生物合成的各种主要的生物大分子的结构和功能,原核和真核生物翻译的基本过程和机制。
蛋白质是生命的物质基础,在细胞的代谢中执行着至关重要的功能,比如酶、受体、离子通道等。绝大部分的生命活动是在蛋白质的参与下完成的,因此,研究蛋白质的生物合成对于深入理解生命活动的规律,在分子水平探索控制生命活动和治疗疾病的途径,推进蛋白质组学的发展是十分重要的。 ;9.1 蛋白质生物合成的概述
在蛋白质生物合成的过程中,氨基酸先与tRNA结合形成氨酰-tRNA,然后在核糖体和mRNA的复合物上,将氨酰-tRNA上的氨基酸加入到多肽链中。核糖体结合到mRNA分子的起始序列上,从mRNA的5到3阅读遗传密码,从蛋白质的氨基端到羧基端合成多肽链。在一个mRNA分子上可以结合多个不同时间开始翻译的核糖体,称多聚核糖体。在原核生物中,翻译的过程是与转录同步进行的,而在真核生物中,转录和翻译在时空上是彼此分开的,转录在细胞核中完成,而翻译是在细胞质中完成的。 ;9.1.1 mRNA是蛋白质合成的模板
在1956年~1961年期间,由Jacob等人领导的四个不同的实验室,通过用T4噬菌体感染大肠杆菌,发现了指导蛋白质合成的直接模板是mRNA。蛋白质体外合成实验,进一步证明了mRNA是蛋白质合成的模板。
mRNA是作为中间物质传递DNA分子上遗传信息的。它具有以下特点,①其碱基组成与相应的DNA的碱基组成一致;② mRNA链的长度不一,这样它所编码的多肽链长度是不同的;③ 在肽链??成时mRNA与核糖体结合;④ mRNA的半衰期很短,代谢速度快。 ; 原核生物中,mRNA的转录和翻译不仅发生在同一细胞空间内,而且这两个过程几乎同时进行,蛋白质的生物合成一般在mRNA刚开始转录时就开始了。原核细胞的mRNA半衰期非常短, mRNA的降解紧跟着蛋白质的翻译过程,一般认为是2min左右。真核生物就很不一样了,其mRNA通常会有一个前体RNA出现在核内,只有成熟的、经过化学修饰的mRNA才能进入细胞质,参与蛋白质的合成。所以,真核生物mRNA的合成和蛋白质合成发生在细胞不同的时空中,mRNA半衰期也相对较长,大约是1到24小时之间。 ; mRNA作为翻译的模板,至少含有一个由起始密码子开始、以终止密码子结束的一段由连续的核苷酸序列构成的开放阅读框(open reading frame, ORF)。原核生物的起始密码子常为AUG,有时是GUG或UUG,而真核生物几乎永远以AUG作为起始密码子。mRNA的5-端和3-端通常含有一段非编码序列(non-coding sequence, NCS)或非翻译区(untranslated region, UTR)。mRNA一般包括3个部分:编码区、位于AUG之前的5-端上游非编码区、位于终止密码子之后的3-端下游非编码区。
ORF的5-端有核糖体结合位点(ribosome binding site, RBS)。RBS含有富含嘌呤的SD(Shine-Dalgarno)序列,能被核糖体结合并开始翻译。每一个ORF的上游一般都有SD序列,每一个ORF编码一个多肽或蛋白质。原核生物的mRNA(包括病毒)一般为多顺反子mRNA(polycistronic mRNA),可以编码几个多肽。多顺反子mRNA是一组相邻或相互重叠基因的转录产物,这样的一组基因称为一个操纵子(见第11章)。一旦mRNA的5-端被合成,翻译起始位点即可与核糖体相结合,而后面几个顺反子翻译的起始会受到上游顺反子结构的调控(图9-1)。真核细胞的mRNA为单顺反子mRNA(monocistronic mRNA),只能编码一个多肽。;标殊丸逝兄址恬睦宠链性畏顿峭弓祁屠说锄淳墩吗厉畴睦镜邀澄扒怒恫夺9.蛋白质生物合成9.蛋白质生物合成;9.1.2 tRNA是氨基酸的运载体
Crick经过比较核酸和氨基酸的大小和形状,认为它们不可能在空间上互补,因此预测可能存在一类分子转换器,使遗传信息
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