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CTAB提取DNA制剂
CTAB
HYPERLINK /view/622769.htm \t _blank 十六烷基三甲基溴化铵 别称:西曲溴铵、溴棕三甲基铵、溴烷铵,鲸熔三甲基溴化铵;CTAB;CTMAB;HTAB;CTABr;阳性皂
英文名 Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide;Cetrimonium Bromide
分类 季铵盐
HYPERLINK /albums/208894/208894.html \l 0$9e7ce6dc7a5db997cd1166b0 \o 查看图片 \t _blank ??
分子式 C16H33(CH3)3NBr
分子量 364.446
熔点:250-237℃
溶解性:13 g/L (20°C)
密度:1.3220 g/ml
CTAB 提取缓冲液:100 mmol/L Tris-HCl (pH8.0),20 mmol/L EDTA-Na2,1.4mol/LNaCl(如表1),2% CTAB,使用前加入0.1%(V/V)的β-巯基乙醇。
提取DNA配方
CTAB为十六烷基三甲基溴化铵,
CTAB提取缓冲液的经典配方
HYPERLINK /view/1846036.htm \t _blank Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;
C HYPERLINK /view/1007733.htm \t _blank β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除 HYPERLINK /view/3851989.htm \t _blank 基因组DNA。
CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌
冷却后0.2-1% HYPERLINK /view/146559.htm \t _blank 2-巯基乙醇(400ul)氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
提取RNA配方
2% CTAB(W/V)
2% HYPERLINK /view/1257820.htm \t _blank 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V)
100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置)
25mM EDTA
0.5g/L 亚精胺Spermidine
2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)
由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC 处理的水配制即可。
CTAB法提取植物DNA
CTAB提取缓冲液配方:1mM Tris-HCl ( PH8.0);20mM EDTA( PH8.0);1.4 M NaCl;2% CTAB(W/V);2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V)。
(1)取材料(3片叶)移入1.5 ml Eppendorf管中,迅速加液氮研磨成粉末状;
(2)加入600 μl的CTAB提取缓冲液(CTAB在65℃水浴预热),加3 μl β-巯基乙醇(0.2-1%),混匀,60-65℃水浴30min-1h。每5min轻轻摇动几次,开始可以颠倒,后期轻缓;
(3)30min后,加入1/3V的5M KAc 混匀冰浴30min,4℃,12000 r/min,离心15 min;
(4)小心吸取上清液,移入新的1.5 ml Eppendorf管中,加入等体积的冷冻 氯仿-异戊醇(24:1),混匀,4℃,12000 r/min,离心10 min。
(5)重复步骤(4)1-2次,以蛋白层不出现为止;
(6)取上清,加等体积冷冻异丙醇,混匀,-20℃沉淀40min,4℃,12000 r/min,离心10 min;
(7)弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀1-2次,12000 r/min,离心10 min;
(8)室温下干燥后(一般干燥5-15 min),溶于20-30 μl去离子水中,加1μl RNase (10μg /μl,终浓度10μg /ml),37℃水浴保温30 min,于-20℃或者-70℃下保存备用。
若要纯化DNA,可做下列操作
(9)加入等体积 冷 氯仿-异戊醇(24:1),混匀,4℃,12000 r/min,离心10 min。
(10)取上清,加1/10V 3M NaAc(pH5.2)和2V冷冻无水乙醇,混匀,-20℃沉淀
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