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2蛋白质翻译后修饰-----末端修饰
蛋白质翻译后修饰——末端修饰(氨基末端、羧基末端)
2010 遗传学
在核糖体上翻译的时候,当氨基酸添加到新生多肽之后,在体内氨基酸残基会发生各种各样的共价修饰。
I、氨基端的修饰
初生蛋白的第一个氨基酸的命运:
在细菌中:在细菌中生物合成蛋白质的第一步一般是甲酰甲硫氨酰-tRNAfmet和第二个氨酰-tRNA通过肽键合成,因此初生蛋白质存在一个甲酰甲硫氨酰位点。
在真核生物中:虽然N末端甲硫氨酰位点从第一个甲硫氨酸获取在成熟蛋白质中很常见,N末端的α-甲基一般很快会被移除,接着在大多数情况下甲硫氨酸残基会被断裂下来。这个作用是依靠甲硫氨酸氨基肽酶的作用,并且这个裂解过程由第二个残基控制。
1)在酵母中(啤酒酵母):如果倒数第二个氨基酸残基有一个0.129nm或更小的回转半径的时候,甲硫氨酸会被完完全全的裂解掉(这些氨基酸有:Gly, Ala, Ser, Cys, Thr, Pro, Val)
2)在真菌或哺乳动物的线粒体中:起始的甲硫氨酸不被去除,但在植物的线粒体中还是会发生的。
在工程菌中:在大肠杆菌中过量表达的蛋白质通过质粒技术会导致一种甲硫氨酸残基保留的不正常现象。
一、乙酰化
1.N端α-乙酰基修饰(α-acetyl)在蛋白质中是很普遍的
在Ehrlich ascite 细胞中:大概有80%的可溶蛋白是N端α-乙酰基修饰的。
在高等真核生物中:有证据表明在这些细胞中氨基酸末端乙酰化是非常普遍的,几乎可以作为高等真核生物蛋白质的一个典型标志。
在低等真核生物中:N端α-乙酰基的比例比较低,但还是存在的
2.N端α-乙酰基化修饰通常是翻译中同时发生的,一般发生在新生肽链大约20-50个残基长的时候
3.N端残基乙酰化修饰的频率(概率)是不同的:一般Ala丙氨酸,Ser丝氨酸 Met甲硫氨酸,Gly甘氨酸, Asp 天冬氨酸 Asn天冬酰胺,lle异亮氨酸,Thr苏氨酸,Val 缬氨酸 其他氨基酸残基
(1)在高等真核生物中的蛋白质比细菌或真菌中的蛋白质更可能发生乙酰基修饰
(2)在大肠杆菌中表达的真核细胞蛋白部分发生乙酰化。
(3)在酵母细胞中表达的突变体iso-1–细胞色素C的N端序列Met-Asp,Met-Glu是完全乙酰化修饰的,大部分N-(乙酰化修饰的Met残基后面紧跟着的是Asp和Glu氨基酸残基。
4.乙酰化蛋白的功能
乙酰化的功能和作用还不是很清楚
提高抵抗蛋白质降解和泛素依赖蛋白酶降解
肽激素乙酰化对黑色素的生物活性和稳定性很大影响
在肌球蛋白N末端的乙酰化修饰对肌球蛋白高亲和结合肌动蛋白是必须的。
二、脂肪酰化
1、Gly残基容易发生脂肪酰化,如在肉豆蔻酰,十四酰(C14:0)中这是非常常见的,在其他的突变体中也是一样。
肉豆蔻酰出现是机率:除去N-末端(第1位)必须的gly残基,蛋白质N-端十四酰基转移酶的底物特异性偏好的第5个位点为Ser,还有第2个位点为小的中性氨基酸残基。
功能:1.疏水的十四酰基修饰会影响到蛋白质和膜的连接以及蛋白质之间的结合。例如在病毒包装中和提供结构稳定性的cAMP-依赖性的蛋白激酶
2.第二种类型的N-端脂酰化修饰主要是棕榈酰化。但也有其它的脂肪酰基基团修饰。这种修饰主要发生在大肠杆菌的胞壁质脂蛋白的S-gly/Cys位点上和革蓝氏阳性菌的青霉素酶上,例如产生的棕榈酰化
三、焦谷氨酰胺(Pyroglutamyl)
一种普遍的修饰,通过N末端的过N-末端脱氨基环化形成吡咯环结构。尽管在体内是由酶催化完成的,但在体外,没有酶的催化下,也可以发生。
四、其它酰基修饰
N端(-甲酰甲硫氨酸((-formylmethionine )存在在原核细胞的新生蛋白中,但在成熟蛋白中几乎没有。蜂毒素存在甲酰甘氨酸((-formylglycine)
丙酮酰基(9(-ketoacyl group pyruvoyl)修饰在多中氨基酸代谢酶中发现,如:乳酸杆菌的组氨酸脱羧酶,大肠杆菌的磷脂酰脱羧酶,C. Sticklandii的脯氨酸还原酶,大肠杆菌的腺苷甲硫氨酸脱羧酶
氧代丁酰((-ketobutyryl) 修饰存在于羊肝细胞中的丝氨酸-苏氨酸脱水酶和假单胞菌的尿刊酸酶,功能:在酶前体N端丝氨酸或苏氨酸脱氨基,类似于吡哆酰辅酶。
在镰刀霉中葡糖醛酸(D-Glucuronic acid)通过一个氨基化合物基团连接到角质酶的N末端上。
5)氨酰基团修饰(Aminoacyl groups)
a.在大肠杆菌中提取出的一种非核糖体,单依赖tRNA的酶。它能催化Leu,Phe,Trp结合到蛋白质中去,大部分的Leu发现结合在N-末端。这个酶具有更多的特性和转移Leu,Phe,或Trp到N-末端为Arg或Lys的蛋白上去。
b.在真核生物中有一种Arg-tRNA-蛋白转移酶活性。N端结合精氨酸的蛋白质可以通
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