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核酸碱基的非谐性振动 - 上海有机化学研究所
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Anharmonic Vibrations of Nucleobases: III,
Structural Basis of Oneand Two-Dimensional
Infrared Spectra for DNA Stac ing...
Article in Acta himica Sinica - hinese Edition- · February 2012
DOI: 10.6023/A1105251
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Jianping Wang
hinese Academy of Sciences
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2012 年第70 卷 化 学 学 报 Vol. 70, 2012
第4 期, 411~422 ACTA CHIMICA SINICA No. 4, 411~422
·研究论文·
核酸碱基的非谐性振动: III, DNA 叠加二聚体的一维和二维红外光谱
王桂秀 王建平*
( 中国科学院化学研究所 分子反应动力学国家重点实验室 北京分子科学国家实验室 北京 100190)
摘要 用量子化学计算方法研究了DNA 碱基单体及其 15 个B 型和2 个G- 四链体的叠加二聚体的非谐性振动光谱特
征. 研究发现, 从碱基单体到二聚体, C=O 伸缩模式之间的相互作用很强, 表现在其非谐性振动频率和非谐性常数都
发生了明显的改变, 特别是在含碱基 G 的叠加体中. 这些变化能在一维和二维红外光谱中很好地表现出来. 利用振动
模式的势能分布和非谐性常数的组成分析, 讨论了叠加二聚体中C =O 模式的离域化程度.
关键词 量子化学计算; B 型DNA 叠加二聚体; G-四链体叠加二聚体; 非谐性频率; 非谐性常数
Anharmonic Vibrations of Nucleobases: III, Structural Basis of One-
and Two-Dimensional Infrared Spectra for DNA Stacking Dimers
Wang, Guixiu Wang, Jianping*
(Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, State Key Laboratory of Molecular Reaction Dynamics,
Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190)
Abstract In this work, DNA base monomers,
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