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stepone 培训手册
内 容
StepOneTM荧光定量PCR检测系统介绍
系统安装条件
培训所需试剂设备及样品
培训程序及时间安排
实验操作流程
软件使用培训
常见问题解答
八、软件及主机常见问题处理
一、StepOneTM荧光定量PCR检测系统介绍
1.1 简介
美国Applied Biosystems公司拥有PCR以及定量PCR技术的双重专利,一直以来致力于PCR技术的开发和应用。StepOneTM是Applied Biosystems公司推出的第四代荧光定量PCR检系统,这套系统除了秉承Applied Biosystems公司荧光定量PCR仪一贯稳定的性能,以及精确、可靠的结果保证外,还配备了最新一代易于操作的定量分析软件,同时可以通过触摸屏实现对仪器的控制,使用者还可以通过远程网络进行仪器监控,这些功能,都使得荧光定量PCR实验变得前所未有的方便。正是得益与其高度灵活性和易用性,甚至对于先前从未有过实时定量PCR经验的科研人员来说,也非常有信心设置和操作StepOne扩增仪。2007年StepOneTM还获得了SelectScience评选的2007年度最佳生命科学新仪器奖Applied Biosystems公司专利的多组分算法,保证了检测装置能方便无荧光污染的进行检测。同时配备波长范围较宽的滤光片,可以收集更多的光信号,提高了信噪比和灵敏度。
图1-1:专利的多组分算法
1.3 光学模块
StepOneTM采用蓝色高功率的光子发射二极管(LED)和高灵敏度的PDT来来激发和检测三种不同的光谱。LED由于是单一波长激发,荧光信号强,消耗低,稳定,寿命长,可以连续使用40年; PDT灵敏度高,逐一检测避免了样品间的荧光干扰。同时,StepOneTM独特的ROX参比染料提高了数据的精确性。
图1-2:参比染料ROX均一化前后数据结果比较
1.4 PCR反应模式
StepOneTM使用一个加热模块,两种加热模式:标准循环模式和快速循环模式。快速循环模式可以在40分钟内完成40循环。更快的升降温,不仅缩短了反应时间,更有效地避免了非特异性结合,提高了PCR反应的特异性。StepOneTM系统支持10-30μl的反应体系,大大节省了实验损耗。
图1-3:不同升降温体现不同的PCR反应特异性
1.5 PCR反应精确性
StepOneTM不仅具有宽广的动力学范围(至少8个),而且精度很高。对于2倍差异模板的区分,可信度可以达到99.7%。StepOneTM荧光定量系统稳定,重复性很好。
二.系统安装条件
位置要求:稳定水平的操作平台放置设备,远离热源,避免阳光直射
空间要求:
操作平台尺寸(长×宽×高):82.5×39.8×81.7cm
重量:23.58Kg (此外,还需要有放置配套电脑的空间及载重)
温度要求:15-30℃
相对湿度:15%~80%,无冷凝
电源:100-240VAC
其它:通用插头接线板
培训所需试剂设备及样品
设备耗材:
1) 台式离心机
震荡混旋器
移液器(10、20、200(l规格)
Eppendorf管,Tip头(带滤膜),乳胶手套等
PCR反应管
灭菌双蒸水
以上物品请您提前准备妥当,基因公司培训人员将使用以上物品进行StepOne定量PCR仪的使用培训工作。
使用试剂:上海晶泰生产“乙型肝炎病毒(HBV)核酸扩增(PCR)荧光定量检测试剂盒”(基因公司提供)
四、培训程序及时间安排
(请至少安排2名实验室长期工作人员参加培训,以熟悉仪器操作并能负责仪器使用)
培训时间安排(1天):
荧光定量PCR技术原理及应用讲座;
StepOne系统技术特点讲解、仪器系统组成和工作原理讲解;
仪器安装及使用培训;
定量PCR演示实验;
软件基本功能综述及使用培训
五、实验操作流程
一)、实验目的:验证机器的重复性、光路的均一性及了解机器和软件的使用及其特点。
二)、实验内容:标准曲线验证及重现性检测(三个完全相同的扩增体系实验)实验。
使用试剂:用上海晶泰生产“乙型肝炎病毒(HBV)核酸扩增(PCR)荧光定量检测试剂盒”(基因公司提供)
三)、仪器及耗材:移液器(10、20、200(l规格),0.1ml PCR光学反应管8个,eppendorf离心管(0.5ml)4个。
四)、实验方法(探针法):
试剂准备:
反应管数 1 N* 混合液的准备 HBV PCR Mix
HotStar Taq 15 μl
0.2 μl 15 μl*(N+1)
0.2 μl*(N+1) 总的体积 μl 91.2 注:N为标准品数,1为阴性对照
试剂使用前都混匀并低速离心。
加样:将定量校准品(使用前先离心,再充分振荡混匀)各5μl分别加入反应管中,每个浓度设置三个重复,同时设置一管NTC(no template c
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