维生素D结合蛋白结构序列预测.docVIP

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2017-08-19 发布于重庆
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维生素D结合蛋白结构序列预测.doc

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维生素D结合蛋白结构序列预测

维生素D结合蛋白结构预测（一）维生素D结合蛋白（Vitamin D-binding protein）序列 sp|Q3MHN5|VTDB_BOVIN Vitamin D-binding protein OS=Bos taurus GN=GC PE=2 SV=1 MKRILVFLLAVAFVHALERGRDYEKDKVCKDLASLGREDFTSLSMVLYSRKFPSGTFEQI SHLVNEVVSLTVTCCAEGADPDCYDNRTSALSDKSCESNSPFPVHPGTPECCTHEGLEKK LCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKDFADRFMYEYSINYGQAPLTLLVGYTK SYLSMVGSCCTSPNPTVCFLKERLQLKHFSLLTIMTNRICSQYAAYGKEKSRLSHLIKFA QKVPTAHLEDVLPLAEDITTILSKCCDSVSEDCIKELPEYAVKLCDNLSTKNSKFKDCCQ EKTPMEIFVCAYFMPASPNPELPDVKLPMNKDVCDEGNTKVLDQYIFELSRKTQIPEVFL TKILESTLKSLDECCHSESSTACLNAKGPQLTRELSSFIQKGQELCADYSENTFTEYKKK LAERLRGKFPDATETDLQELVAKRSDFASKCCSVNSPPLYCNSEIDAEINTLQS （二）理化性质预测 1.等电点（pI）、相对分子质量（MW）计算维生素D结合蛋白（Q3MHN5）等电点、相对分子质量预测结果图 2.蛋白质参数预测维生素D结合蛋白（Q3MHN5）参数预测结果图 3.氨基酸组成、电荷分布、疏水区域、跨膜区域等预测维生素D结合蛋白（Q3MHN5）SAPS软件部分预测结果图 4.酶切结果预测 The peptide masses from your sequence are: [Theoretical pI: 5.36 / Mw (average mass): 53342.02 / Mw (monoisotopic mass): 53307.06] mass position #MC modifications peptide sequence 1832.9388 425-440 0 LRGKFPDATETDLQEL 1484.6573 459-471 0 LYCNSEIDAEINT 1446.7951 347-358 0 FELSRKTQIPEV 1410.6205 91-103 0 LSDKSCESNSPFP 1408.7179 17-27 0 LERGRDYEKDK 1387.7004 126-136 0 LKHQPQEFPTY 1376.7420 316-328 0 ASPNPELPDVKLP 1366.5514 104-116 0 VHPGTPECCTHEG 1353.5773 329-340 0 MNKDVCDEGNTK 1256.4848 79-89 0 ADPDCYDNRTS 1219.5147 137-147 0 VEPTNDEICEA 1210.4351 371-381 0 LDECCHSESST 1198.5231 295-304 0 FKDCCQEKTP 1155.6157 47-56 0 LYSRKFPSGT 1065.4339 186-196 0 VGSCCTSPNPT 1052.5523 148-155 0 FRKDPKDF 943.5247 414-420 0 FTEYKKK 938.5054 225-232 0 AYGKEKSR 924.4421 35-42 0 LGREDFTS 918.4713 399-406 0 IQKGQELC 891.4822 274-280 0 IKELPEY 817.4090 176-182 0 VGYTKSY 805.4414 391-397 0 LTRELSS 799.3104 407-413 0 ADYSENT 777.4465 288-294 0 LSTKNSK 762.3781 165-171 0 INYGQAP 755.3062 262-268 0 LSKCCDS 723.3784 442-447 0 AKRSDF 692.2596 160-