logo31优化反应物利用画图软件gaussview构建反应物cn的分子.ppt

Logo Company Logo Gaussian 03 简介及应用 汇 报 人 ： 许建文 专 业 ： 化工学院 指 导 老 师 ：孙永利 报告内容 1.概述 2.主要应用 3.具体应用过程 1 概述 计算可以对体系的基态或激发态执行。可以预测周期体系的能量，结构和分子轨道。因 ，Gaussian 03 可以作为功能强大的工具，用于研究许多化学领域的课题，例如取代基的 响，化学反应机理，势能曲面和激发能等等。 2 主要应用 分子能量和结构研究 过渡态的能量和结构研 化学键以及反应的能量 分子轨道 偶极矩和多极矩 原子电荷和电势 振动频率 红外和拉曼光谱 反应物→中间体→过渡态→中间体/产物 本次实验主要利用量子化学方法研究整体系的反应，通过寻找反应中间体及过渡态的详细结构，了解中间产物的热力学及动力学稳定性，得到不同反应路径，分析得出反应机理。 3 具体应用过程 3.实验步骤 优化反应物 优化中间体 优化过渡态 链接反应路径 绘制剖面图 本次实验的全过程都是在计算机上完成的，主要运用Gaussian 03软件进行理论的模拟计算，其他辅助的软件包括三个画图软件，GaussView、ChemDraw和Origin。 3.1 优化反应物 利用画图软件GaussView，构建反应物CN的分子构型，设置键长和键角的值 编辑运行命令，用Gaussian 03模拟运算 键长 模拟计算软件 Gaussian 03运行过程 运行 错误 运行结果正确 从结果文件中读取键长和键角值 用ChemDraw绘制平面构型 3.2 优化中间体 首先根据反应物的构型，使用GaussView构建可能形成的中间体几何构型，然后使用计算软件Gaussian 03进行模拟运算优化，最后打开Gaussian 03运行的结果文件，读取中间体几何构型的键长、键角，用ChemDraw画图软件画出详细平面构型。 3.3 优化过渡态 首先打开运行正确的中间体构型图，设定中间体可能发生的构型变化，然后运用计算软件Gaussian 03优化过渡态，最后打开.out结果文件，读取过渡态几何构型的键长、键角，用ChemDraw画图软件画出详细平面构型。 中间体 中间体 过渡态 从所有的结果文件中读取总能量值 物质种类 总能量 ⊿E（Kcal/mol) B3LYP/ 6-311G(d,p) R（CN+O) -167.6267895 0 P1(CO+N) -168.1595239 -334.2396935 P2(CNO) -167.8741509 -155.1955318 a1 -167.1928944 272.2275213 a2 -167.6199232 4.307944085 a3 -167.8443836 -136.5194131 b1 -166.2972182 834.1783519 b2 -166.8814208 467.6473039 c1 -166.2896889 838.9022648 c2 -167.4323321 122.0033506 c3 -166.0743144 974.0290876 d1 -167.8030551 -110.5897425 d2 -167.8443836 -136.5194087 a3/P1 -167.7685853 -88.9632796 a2/c2 -167.288321 212.3564887 a1/c2 -167.1105316 323.9022645 c2/d1 -167.3839435 152.3625425 d1/p1 -167.5333056 58.6521483 d1/p2 -167.6820313 -34.6589412 反应物、产物、中间体和过渡态的能量图表 3.4 确定过渡态和中间体的链接 反应物→中间体→过渡态→中间体（产物） 利用Gaussian 03软件，使过渡态找到其前后对应的中间体，然后再根据中间体和过渡态的能量值，最终确定出一条完整的可行的反应路径。 3.5 绘制势能面剖面图 根据表格中的能量值，和前面步骤中得到的反应路径，使用Origin画图软件，绘制出该反应系统的势能面剖面图 。 势能面剖面图 （1） R(CN+O) → a1 → a1/c2 → c2 → c2/d1 → d1 → d1/P1 →P1 （2） R(CN+O) → a2 → a2/c2 → c2 → c2/d1 → d1 → d1/P2 →P2 （3） R(CN+O) → a3 → a3/P