染色体碱基序列的联合多重分形分析 the joint multi-fractal analysis of the base sequence of chromosomes.pdfVIP

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染色体碱基序列的联合多重分形分析 the joint multi-fractal analysis of the base sequence of chromosomes

第30卷第2期 电子与信息学报 Vbl.30No.2 2008年2月 JournalofElectronics&Information Feb.2008 Technology 染色体碱基序列的联合多重分形分析 陈双平∞ 韩凯@@ 马猛笋 王煦法③ …(中国科学技术大学电子工程与信息科学系合肥230027) …(中国科学技术大学计算机科学与技术系 合肥230027) …(中原工学院计算机学院郑州450007) …(安徽大学计算机科学技术学院合肥230032) 摘要:多重分形谱可以用于分析一条染色体碱基序列的概率分布情况,联合多重分形谱可以区分两条染色体碱基 序列的概率分布之间的差异。该文将联合多重分形谱应用于实际染色体中碱基序列和随机产生碱基序列的比较分析 中。实验结果表明:同一物种的不同染色体上的碱基序列可视为来自同一信源的输出;而不同物种的染色体碱基序 列是由不同信源产生;且染色体碱基序列不同于随机产生的碱基序列。该方法还可以应用于其他信号的分析和模 型评估中。 关键词:离散稳恒信源;联合多重分形分析;DNA序列 中图分类号:TN911.72,Q349.5 文献标识码:A TheJointMulti廿actaLloftheBase of Analysis Sequence chen HanKa产国 Ma xu_f≯ shuang—ping∞ Meng②④wang ①(D印8nme疵o,觑ec£rD佗钯上流9i佗ee疵扎9n佗d玩厂Drmo£iD佗&ie扎ce,嬲Te日e.触230027,c%流。) ②(D印n庀me优D,∞妒牡ter钯nce口佗d死c危noa凹弘吣Te肌犯i230027,C仇i札0) ③(Schoo{0,GDmputer o礼d ④(Sc危Dofo,Cb竹印u£ep.%ie咒cezlec九nD忉可,An危uiD‰it,ersi亡暑,,王峰i230032,C玩in∞ Abstr鼬t:The oftheDNA ofacllrom080merenect8it8 mldti_frauct甜spectrum8equence probabilitydistribution, andthe multi-fractaloftwoDNA canbeusedtodiscriminatetheir joint spectrum sequences di8tributions.By multi—fractal to theDNA ofchromosomesand employingjoint spectrumanalyze sequence8 randomlygenerated to hasbeensho唰’n chromosomesofthesame sequences di8tributions,it that,different specie accordingpredefined as differentcannot canbeviewed

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