蛋白质泛素化的生物信息学分析.pdfVIP

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摘要 摘 要 蛋白质翻译后修饰对蛋白质的成熟,结构和功能的多样性起着重要的作用。然 而由于蛋白质翻译后修饰的多样性、普遍性、动态性,传统的实验方法严重制约了 研究进展。现在,在实验研究基础上,基于不同算法开发了多种计算工具,用来预 测蛋白质共价修饰的位点,大大加快了研究的进展。 泛素化作为一种十分重要的翻译后修饰,在细胞内发挥着重要的作用。 lB-TrCP(beta-transducinrepeat.comainingprotein)是众多E3连接酶中的一种,通过识 别某些特定的底物引导其泛素化,从而参与生命活动中各项重要过程。在本研究中, 1.0。另外,我们从GPS-BeTrIP 我们开发了针对13.TrCP结合位点预测的GPS.BeTrlP 对促进其降解起重要作用。 近来研究表明,在原核生物中,原核类泛素蛋(prokaryoticubiquitin.1ikeprotein, 1.0。我们收集了238个不知道确切位点的底物,并以此检测GPS.PUP1.0性能。我 们成功预测出了~85%底物蛋白质,而且每个底物蛋白质上至少有一个潜在位点。不 Ontology) 仅如此我们还系统的对潜在的pupylation底物做了更深一步的GO(Gene 注释。分析发现pupylation的底物十分广泛,参与调节各种生物学过程,如压力应 答和新陈代谢等。 综上所述,我们对以上两种翻译后修饰所做的系统性分析为实验学家提供了非 常可靠的数据资源。我们有理由相信将我们的工作与实验验证有机的结合将会大大 推动这两种翻译后修饰的研究。 关键词:蛋白质翻译后修饰,13-TrCP,泛素化,PUP,pupylation V ABSTRACT ABSTRACT to Post-translational critical modifications(PTMs)aleprotein function.NowPTMsexist invivowith and dynamic structure ubiquitously protein to withtraditional itis them difficult methods.Recently diversity,makingvery study fasterinPTMs besides becoming study,for experimental been for invarious have developed computationalpredictorsimplementedalgorithms modificationsites post—translational prediction. a

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