植物位点特异性甲基化研究的引物设计及PCR体系优化.pdfVIP

植物位点特异性甲基化研究的引物设计及PCR体系优化.pdf

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植物位点特异性甲基化研究的引物设计及PCR体系优化

圆园16 35 9 :1686-1693 20 16 9 , () 农 业 环 境 科 学 学 报 年 月 允燥怎则灶葬造 燥枣 粤早则燥鄄耘灶增蚤则燥灶皂藻灶贼 杂糟蚤藻灶糟藻 . PCR [J]. , 2016, 35 9 1686-1693. 王鹤潼,宋 婕,崔伟娜,等 植物位点特异性甲基化研究的引物设计及 体系优化 农业环境科学学报 () WANG He-tong, SONG Jie, CUI Wei-na, et al. Primer design and PCR condition optimization for plant site-specific methylation[J]. 燥怎则灶葬造 燥枣 粤早则燥-耘灶增蚤则燥灶原 皂藻灶贼 杂糟蚤藻灶糟藻, 20 16, 35 9 1686-1693. () 植物位点特异性甲基化研究的引物设计及PCR 体系优化 1,2 3 4 5,6 3 1 1 1 王鹤潼 , 婕 ,崔伟娜 ,曹 霞 ,何 蕾 ,贾春云 ,惠秀娟 ,台培东 , 1 1* 成智博 ,刘 宛 1. 1100 16 2. 110 163 3. (中国科学院沈阳应用生态研究 污染生态与环境工程重点实验室,沈阳 ; 辽宁何氏医学院,沈阳 ; 辽宁大 110036 4. 201418 5. 110866 6. 学,沈阳 ; 上海应用技术学院,上海 ; 沈阳农业大学,沈阳 ; 通辽市农业科学研究院蔬菜 ,内蒙古 通辽 028000 ) 要 通过设计大量引物,探索在植物甲基化引物设计中长、短引物的设计方法及其相应的PCR 条件,同时比较不同Taq 酶对甲 17~30 bp Touch-down PCR 31~50 bp 55 益 基化率影响。结果表明 短引物适合使用 程序 ,但特异性差、成功率低; 长引物使用 退火 60 益延伸的PCR 条件成功率最高,其中反向引物的长度及Tm 小于正向引物较佳;高保真酶因其3忆寅5忆外切酶活性不宜用于甲基 化研究,而EpiTaqTM HS 在PCR 结果中表现最佳。 Taq PCR 关键词 植物甲基化;引物设计; 酶; 条件 Q943.2 A 1672-2043 2016 09-1686-08 doi:10.11654/jaes.2016-0173 中图分类号:

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