海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株多间隔序列分型.pdfVIP

中国媒介生物学及控制杂志2014 年8 月第25 卷第4 期 Chin J Vector Biol Control, August 2014, Vol.25, No.4 ·289 · ·论 著· 海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株 多间隔序列分型 1 2 2 2 2 2 1 程雪琴 ，金玉明 ，老世军 ，黄昌和 ，黄芳 ，贾鹏本 ，张丽娟 1 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所无形体室，北京102206；2 海南省疾病预防控制中心，海口570203 摘要：目的 采用多间隔序列分型（MST）对从海南省澄迈县发热患者及野鼠分离的62 株斑点热群立克次体进行分型研 究。方法 根据文献检索，应用9 对成功用于斑点热群立克次体MST 分型引物，对实验62 株菌进行PCR 扩增及测序。 校正后序列进行Blast 分析。同时，对序列进行Megalign 比对分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株细菌成功测序的6 段 间隔序列按一定顺序拼接并构建进化树。结果 使用6 对间隔序列引物扩增实验菌株，结果显示每对引物扩增序列均显 示较大的变异性，共获得48 个变异型，以h3 为代表的主要变异型占21.7% （13/60），剩余的47 个变异型为独立型，分别占 1.6%。进化树分析结果显示48 个变异型均归为一簇。同其他参考菌株比较发现，黑龙江立克次体与上述菌株关系密 切。SNPs 分析发现位点变异主要以T-C 转换及A-G 转换为主。结论 海南地区斑点热群立克次体分离株非编码间隔 序列呈高度变异性。MST 分型较传统的血清表型分型以及MLST 分型更具有鉴别能力，对未来立克次体暴发流行可提供 快速有效的流行株追踪。 关键词：斑点热群立克次体；多间隔序列分型；海南省澄迈县 中图分类号：R376 文献标志码：A 文章编号：1003-4692（2014 ）04-0289-05 DOI ：10.11853/j.issn.1003.4692.2014.04.001 Multispacertypingofspottedfevergrouprickettsiaeisolated fromChengmaicountyofHainanprovince,China 1 2 2 2 2 2 1 CHENG Xue⁃qin , JIN Yu⁃ming , LAO Shi⁃jun , HUANG Chang⁃he , HUANG Fang , JIA Peng⁃ben , ZHANG Li⁃juan 1 Department of Anaplasma, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention , Beijing 102206, China; 2 Hainan Center for Disease Control and Prevention, Haikou 570203, Hainan Provi