第三代DNA测序及其相关生物信息学技术发展概况.pdfVIP

食品研究与开发 ２０15 年 5 月 专题论述 Ｆood Research And Development 第 36 卷第 10 期 143 DOI ：10.3969/j.issn.1005-6521.2015.10.038 第三代DNA测序及其相关生物信息学 技术发展概况 杨悦，杜欣军，梁彬，郭季冬，程晓真，王硕* （天津科技大学 食品营养与安全重点实验室，天津300457 ） 摘 要 ： 本文介绍了第三代 DNA 测序的技术原理及应用现状，并对相关的生物信息学技术进行了综述。第三代测序 技术以单分子测序为主要特点， 目前已广泛应用于食品科学及生命科学研究的各个领域， 其代表有 Heliscope BioScience 公司的 SMS 技术、Pacific BioSciences 公司的 SMRT 技术等。 本文同时归纳总结了基因组学相关的生物信 息学发展状况及常用的数据库。 关键词 ： 基因组学；第三代DNA测序技术；生物信息学；数据库 Development of the Third Generation Sequencing Technologies and Related Bioinformatics YANG Yue ，DU Xin-jun ，LIANG Bin ，GUO Ji-dong ，CHENG Xiao-zhen ，WANG Shuo* （Key Laboratory of Food Nutrition and Safety ，Tianjin University of Science and Technology ，Tianjin 300457 ， China ） Ａｂｓｔｒａｃｔ ： In the present study ， the principles and applications of the third generation of DNA sequencing technology were summerized ， as well as the progresses of bioinformatics involved genome sequencing. The third generation DNA sequencing technology was characterized by single DNA molecular and had been used in many fields of food science and life science research ， for instance ， SMS from Heliscope BioScience and SMRT from ， Pacific BioSciences. Meanwhile the developement of bioinformatics and the main bioinformatics databases were summarized in the paper. Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ ： genomics ； the third DNA sequencing technology ； bioinformatics ； database 1986 年美国科学家 Thomas Roderick 首次提出基 覆地的变化， 同时，DNA 测序获得的大量数据促进了 因组学的概念， 基因组学包括核苷酸测序及序列分 生物信息学的产生和发展，利用生物信息学的方法分 析、基因定位、基因功能分析等内