植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel.PDF

生物多样性 2016, 24 (12): 1345–1352 doi: 10.17520/biods.2016230 Biodiversity Science http: // •数据论文• 植物标本标签设计的原则及R程序包herblabel * 张金龙 朱慧玲 刘金刚 Gunter A. Fischer (嘉道理农场暨植物园植物保育部, 香港) 摘要: 植物标本是分类学、生态学和分子生物学最重要的凭证之一。标本的采集和鉴定信息需清晰、准确、美观 地展示和保存于标本标签中, 不能有歧义以及拼写错误。在标签的制作过程中, 数据输入的方式要简单、直接, 标 签文件生成过程中最好能自动分析错误, 且在打印之前要便于修改和调整。本文探讨了打印植物标本标签的若干 原则以及注意事项, 并介绍了用R语言编写的herblabel程序包生成植物标本标签以及鉴定标签的过程。herblabel程 序包基于Darwin Core和CVH5.0数据交换标准, 可快速批量生成几种样式的RTF标签, 且标签简洁、美观, 易于编 辑。herblabel程序包具有检查地点完整程度, 学名拼写和接受状态, 科、属在APG等新系统下的对应关系等功能, 可有效减少数据录入过程中产生的错误。此外, 本程序包在打印标签时使用的是基于Darwin Core标准保存的标本 数据库, 不仅方便统计和管理, 也可以直接用于全球生物多样性信息网络(GBIF)数据共享或者数字植物标本馆的 建设。该程序包可显著提高植物标本馆标本制作、管理和信息录入的工作效率, 减轻工作人员的负担, 并在植物 生物多样性编目中发挥重要作用。 关键词: 标本馆; 植物标本; 标签; R语言程序包; 拼写; APG III; Darwin Core Principles behind designing herbarium specimen labels and the R pack- age ‘herblabel’ * Jinlong Zhang , Huiling Zhu, Jingang Liu, Gunter A. Fischer Flora Conservation Department, Kadoorie Farm and Botanic Garden, Hong Kong Abstract: Voucher specimens are essential for plant taxonomy, ecology, and plant molecular biology. Collec- tion and identification information should be clearly, accurately and formally printed on herbarium labels, without confusion or spelling mistakes. During the preparation of the labels, data entry should be straight-forward and easy to manage. Ideally, the herbarium label printing software should conduct a thor- ough evaluation to avoid potential errors, and should issue warnings accor