EGFR19基因体细胞突变焦磷酸测序法室内质量控制的建立.pdfVIP

• 222 • 临床检验杂志2016 年3 月第34 卷第3 期 Cbin j Clin Lah Sci ,M缸 2016， Vol. 34 ， No.3 001: 10. 13602/j. cnki. jcls. 20 16. 03. 18 ·质量管理研究­ EGFR19 基因体细胞突变焦磷酸测序法室内质量控制的建立* 钟东1 ，周钢2 ( 1. 长沙卫生职业学院科研处，长沙 4101∞; 2. 中南大学临床药学理研究所， 长沙 41仪削) 摘要: 目的 试建立适用于永庆生长因子受体基因(EGFRl9) 体细胞突变焦确酸测序法日常检测的室内质量控制体系。 方法 选择EGFRl9E746_A750del( 1 ) 突交为 10% 的样本作为外部质控品，前20 次的检测数据采用Jp 刻法控制其检测质量，建立 EGF阳， 9基因体细胞突变焦磷峻测序的 L-j 质校图。 结果 该质校品前20 次的 SI 上限和SI 下限均在n2s内，用 L-J 质拉图计算 在即刻法质控的基础上获得的前20 次外部质控品9C114G 的突变比例，其均值(均为 1 1. 78% ，标准差($)为 1. 70% ，变异系数 (CV) 为 14. 46%。 结论 用 EGF阳， 9 质控品绘制 L-j 质控圈，可对实验误差进行控制。 关键词:农皮生长因子受体基因; 1依磷峻ìJIl Jf- ; 质量控制; L-J 质拉图 中团分类号:R34 文献标志码: A 焦磷酸测序(pryo-sequencing) 具有准确性高、 三方机构的高通量测序法校验其突变。 1 . 3 质控数据的选择 按照本实验室前期建立的 速度快、结果相对直观、能区分杂合比例、且能检测 目的片段上未知突变等特点，非常适合已知序列的 EGFR19 参考模型图川 ，根据 EGFR19 E746 _ 短片段测序。研究发现，表皮生长因子受体基因 A750 del ( 1 ) 体细胞突变焦磷酸测序图的第9 位C (EGFR19) 基因突变与非小细胞肺癌( non-smaU cell 峰和第 14 位 G 峰( 一倍峰)的峰值比例计算出该 lung cancer , N5CLC ) 靶向治疗的疗效具有相关性， 突变型所占突变比例(图 1 ) 。在常规实验条件下分 绝大多数携带EGFR 基因突变的患者疗效显著[1 -2) 。 别连续测定向浓度同批号(核酸浓度: 13. 63 nglμL， 目前临床检测尚缺乏成熟的焦磷酸测序室内统计学 批号:CI30106-T1 )的外部质控品 20 d 以上， 得到一 组数据，采用即刻法(Crubs 异常值取舍法[4] )对数 质量控制体系，建立一套完善且精准的质控体系对 EGFR19 基因检测具有重要临床实用价值。 据进行质量控制，所得结果录人到Exce12∞3 软件， 1 材料与方法 得到均值(主)、标准差($)和变异系数( CV) 。经计 算，51 上限=(最大值-平均值)/$，51 下限=(平均 1. 1 仪器 计算机，Windows XP 操作系统，Excel 值-最小值)/s ， 02s 和 n3s 为即刻法质控的 51 参考 值 2003 软件，打印机等。 ，当 51 上限 和 51 下限 o2s 时，表示处于控制范围 1. 2 外部质控品的选择 采用 日 常检测中 Eι 内; 位于o2s - n3s 时，处于警告状态; n3s 时，属 FR1 9 E746_A750del ( 1 ) 突变约为 10% 的核酸样品 失控 (S) 。