技术要求及其他包号:01品目号:001设备名称:二代基因组测序.DOC

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技术要求及其他包号:01品目号:001设备名称:二代基因组测序

技术要求及其他 包号:01 品目号:01-01 设备名称:二代基因组测序系统 数量:1 一、主要技术指标 1.总体要求: 1.1 必须是原包装未经使用的全新设备。 1.2 有可靠的售后服务保证。 1.3 一台仪器可以实现目标片段测序,人类全转录组测序,人类全外显子组测序,未知基因组序列的全新测序,已知基因组序列的再测序,mRNA测序分析,染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)研究,转录组测序,表达谱分析,扩增子测序,拷贝数分析,甲基化,双端配对测序等应用和研究目标。 2.工作条件: 2.1 工作温度:20-30℃ 2.2 工作湿度:40-60% 2.3 电源: 220 V±10%,50/60Hz 3.技术规格要求: *3.1测序原理:系统采用最先进的半导体芯片测序,直接将化学信号转化为电信号,实时检测测序时产生的氢离子浓度;无激发光源,无需荧光标记,无需照相系统。 *3.2通量:有多种通量的测序芯片灵活可选,适合不同通量需求的应用。单次测序通量可达15Gb,并有进一步扩展的空间,测序Reads可达80M以上,目前已有的三种芯片通量分别是: I型芯片(reads数目300-500万,在200 bp读长模式下可产生0.6-1.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生1.2-2.0 Gb数据) II型芯片(reads数目1,500-2,000万,在200 bp读长模式下可产生3.0-4.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生6.0-7.2 Gb数据) III型芯片(reads数目6,000-8,000万,在200 bp读长模式下可产生10-15 Gb数据) *3.3读长:单端测序长度不少于600 bp,并有继续延伸读长的空间。 *3.4数据量:I型芯片可产出2 Gb数据、II型芯片可产出7.2 Gb数据、III型芯片可产出15 Gb数据。 *3.5运行速度:可在4小时内完成单端读长400 bp的测序任务;可在2.5小时内完成单端读长200 bp的测序任务;对于读长小于200 bp的测序任务,则运行时间更短。 *3.6灵活性:拥有单独分离式的自动文库构建、模板制备系统以及测序系统。可并行处理,并且可以分步质控,保证高效测序。 3.7 仪器设置时间:提供带有RFID标签的即装即用试剂盒,装配设置时间少于15分钟 3.8 可在1张芯片上完成多样本和多位点的同时测序 3.9 读取精度:原始数据准确性≥99.0% *3.10配套试剂完善,厂家固有的靶向基因检测试剂盒超过30个,另外还有人类全外显子组、全转录组检测试剂盒,以及文库准备试剂盒、模板制备试剂盒、测序试剂盒、质控试剂盒等。 3.11支持384个样本平行分析 3.12客户定制服务(customer panel): *3.12.1可以同时完成6144重PCR反应 *3.12.2起始DNA量仅需10ng *3.12.3 2.5小时内可以完成读长为200bp的测序反应 3.13肿瘤与疾病的检测 *3.13.1投标产品厂家有能力提供能够同时检测基因单碱基突变、拷贝数变异以及融合突变的检测试剂盒 *3.13.2投标产品厂家提供的肿瘤相关基因检测及研究试剂盒超过10个,其中有可同时检测16, 000多对引物肿瘤检测试剂盒,测序反应仅需4个小时 *3.13.3投标产品厂家提供的疾病及药物代谢相关基因检测及研究试剂盒超过20个,其中有可同时检测10, 000多对引物的疾病检测试剂盒,该试剂盒包括:神经肌肉疾病237种疾病,88个基因;心脏病143种疾病,61个基因;发育疾病143种疾病,61个基因;代谢疾病44种疾病,28个基因;其他(遗传性癌症、失明等)196种疾病,75个基因。测序反应仅需2.5个小时。 3.14人类身份鉴定:厂家提供可用于人类身份鉴定研究的检测试剂盒 4.配备定制服务器及软件: 内置Torrent服务器并且预装了Torrent Suite软件 可将仪器测序数据进行碱基响应比对(base call alignment),输出符合行业标准的数据格式 厂家提供50个数据分析插件供用户对数据进行后续分析 5.配置要求: 5.1 系统(包含内置服务器) 一套 5.2 全自动化模板制备和芯片上样系统 一套 5.3 安装培训试剂盒 一套 5.4 质控试剂盒 一套 5.5 配套OT2的芯片离心机

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