基因表达调控的分子机制.PPT

第十章基因表达调控的分子机制 第一节 概述 一、基因表达调控的定义 二、基因表达调控涉及的环节 三、基因表达调控涉及的分子间相互作用 第二节 两类遗传信息的差异 一、I类信息和Ⅱ类信息 二、I类信息和Ⅱ类信息的差别 1 信息解读体系 2 信息解读范围 3 信息解读方式 4 信息编码方式 5 信息密码的简并性 三、调控密码形式的复杂性 氨基酸残基与碱基形成氢键的复杂性 氨基酸残基与碱基之间的van der waal力作用 第三节调节蛋白质的对称性与识别序列的对称性 一、调节蛋白的组织形式 高级结构 调节蛋白以多聚体形式与DNA作用的优点 二、调节蛋白质的对称性与其识别序列之间的关系 调节蛋白质多聚体可能的组合方式（图10-2） 调节蛋白二聚体可能识别的DNA序列特征 第四节 λ噬菌体的阻遏蛋白和Cro蛋白所组成的转录开关系统 一、λ噬菌体由源原周期转变为裂解周期的基因表达及CI及Cro蛋白的作用 二、λ阻遏蛋白及Cro蛋白 λ阻遏蛋白 Cro蛋白 三、λ阻遏蛋白及Cro蛋白与操作子结合的机制 （一）λ阻遏蛋白与OR操作子结合的机制 λ阻遏蛋白对早期操纵元的负调控作用 λ阻遏蛋白的正调控作用 阻遏蛋白的表达的自身身负调控 （二）Cro蛋白与操作子结合的机制 第五节调控蛋白质的结构花式及其与DNA相互作用的细微机制 一、概述 二、α螺旋—转角—α螺旋 （一）λ阻遏蛋白N－末端及其与操作子的结合 λ阻遏蛋白N－末端结构域的结构（图10－10） λ阻遏蛋白二聚体与操作子的结合模型（图10－11） （二）Cro蛋白结构及其与操作子的结合 Cro蛋白的结构（图10－12） 操作子上受Cro蛋白保护的基团（图10－13） （三）CI、Cro蛋白及λ操作子相互作用的保守基团 与CI、Cro蛋白结合的λ操作子的保守碱基 决定CI、Cro蛋白与O位点结合亲和力的氨基酸 （四） α螺旋—转角—α螺旋结构的普遍性 其他原核生物调控蛋白的α螺旋—转角—α螺旋结构（表10-1） 识别螺旋 真核生物调控蛋白中的α螺旋—转角—α螺旋结构 （1）酵母结合型调控蛋白 （2）AntP及其同源蛋白 （五）识别螺旋与DNA碱基序列作用的机制 同种噬菌体阻遏蛋白及Cro蛋白识别螺旋的置换效应 异种噬菌体阻遏蛋白识别螺旋的互换效应 结论 三、锌指结构 （一）TFⅢA转录因子的结构域 氨基酸数目 N端结构域（12-276Aa残基） C端结构域（276-344Aa残基） （二）TFⅢA锌指结构的组成 （三）C2／H2型锌指蛋白保守Aa及其形成的结构 锌指可能存在的三维结构（图10－18a、b） 3 TFⅢA与5SrRNA基因启动子的结合 结合50bp 可能是锌指上的α-螺旋与DNA结合 （四）C2／C2型锌指 1 结构 配位结构：由Zn++离子与四个Cys残基形成配位结构 通常不重复 其DNA结合位点较短，且呈回文序列 2 代表 （1）固醇类激素受体 糖皮质激素受体和雌二醇受体都有两个锌指结构，形成α-螺旋，再折叠形成一个大的球形结构。 α-螺旋的芳香侧链与连接两个螺旋的?折叠一起形成一个疏水中心。螺旋的N末端与DNA的大沟接触 固醇类激素受体借与DNA的结合形成二聚体 第一个锌指的右侧控制DNA的结合的特异性 第二个锌指的左侧控制二聚体的形成 （2）酵母的转录激活因子GAL4 锌指交换实验证明，决定DNA识别特异性的氨基酸序列在锌指以外的部位 四、Leu拉链 1 Leu拉链结构（图10－19d） Leu拉链蛋白分子单体含有4-5个Leu残基，精确地相距7个氨基酸残基， 在α螺旋的某个侧面每两圈出现一个Leu，排成一排。两个蛋白质单体分子的两个α螺旋通过Leu残基之间的疏水作用形成一条拉链 2 代表蛋白 GCN4，癌蛋白Jun，Fos，Myc，增强子结合蛋白C/EBP等 3 Leu拉链蛋白的DNA结合序列 Leu拉链蛋白的DNA结合序列不在Leu拉链区 Leu拉链区相邻的氨基酸序列参与DNA的特异性结合 两个Leu拉链形成一个Y型结构，与DNA结合。这种结构称为bZIP基序 4 Leu拉链的作用 充当独立的蛋白质二聚体形成区域 拉链可以协助形成纯合或异源二聚体 第六节不同结合位点上蛋白质之间的相互作用 一、蛋白质相互作用的方式 （一）转录激活因子的功能结构域 DNA结合结构域 转录激活结构域 多数转录激活结构域包含一段酸性氨基酸保守序列 酸性激活区在进化上是高度保守的 有的转录激活结构域富含Gln或Pro （二）转录因子激活区激活转录的机制 转录因子作用对象是保守的转录机构成分 结合于DNA的蛋白质因子之间的相互作用的机制——Looping假说 （1）假说 位于不同DNA结合位点上的两个蛋白质，可以通过远距离发生相互作用，实现基因转