基因体医学研究中心执行成效-研究发展处.PDF

基因體醫學研究中心執行成效 一、各重點領域或研究中心之整體規劃及具體實施策略 研究中心整合醫學校區及校總區從事生醫領域研究之相關同仁，進行跨院系所之合作， 建立以基因體醫學為主之核心實驗室技術平台。共包括十個核心實驗室，分別為蛋白體、基 因微陣列、微生物基因體、組織庫、基因轉殖動物、基因剔除鼠、遺傳流行病學、生物資訊、 幹細胞、代謝體核心，同時搭配一教學資源中心以推動人才培育與資源整合。以這些技術平 台為基礎，擬定癌症、感染症、心血管疾病等研究目標，提出新的治療及預防技術及策略， 共同解決國人之重要病症。同時，藉由醫學卓越研究中心之整合基礎與臨床研究，進一步提 昇臺灣醫學研究的核心力量。研究中心同仁在肝炎、癌症及感染疾病等研究領域，均有非常 傑出的研究成果，在一流之國際學術論文期刊發表， 2012 年達 228篇；而相關之產學合作、 專利申請案，亦逐年遞增。 基因微陣列核心實驗室： 創建一個「世界級的功能性基因體研究核心，提供使用者所需的功能基因體服務，藉以 厚植台灣生醫實力，提升台灣生技產業競爭力」。 （一）提供最先進的基因體研究平台 1.供應高品質的微陣列服務 2. 新世代定序儀分析系統 3. 供應基因體驗證服務 4. 客製化服務：由核心實驗室協助使用者進行非制式化服務的設計 （二）一站式單一窗口服務 （三）研發最新的基因體學服務項目提供： 1.第三代 NGS 平台(Pacific Biosciences) 2.第四代 NGS 平台(Ion Torrent 與 Ion Proton) 3. RainDance 特定序列 DNA 定序文庫製備 (Amplicon Sequencing NGS library preparation) 針對基因、微核醣核酸、基因間長鏈非編碼 RNA(LincRNA)與基因拷貝數建立晶片系統。 提供： 1.Affymetrix新版基因表現晶片 ST2.0 array 2.Affymetrix微核醣核酸表現晶片 miR3.0 array 3.Affymetrix 基因拷貝數晶片 CytoScan array 微生物基因體核心實驗室： 著重於微生物之致病相關基因體研究，利用基因體學上的策略針對感染性疾病未解決的 問題進行研究。此外本核心實驗室已建立多種可應用於微生物基因體學分析之技術，開放校 總區及醫學院區相關研究之技術支援及服務。 茲將本核心實驗室針對所擬定之特定研究目標摘要如下： 1 1. 繼續提供現有的服務且進一步的發展新的技術平台以提供更多元之服務。 2. 研究傳染性病原體與宿主交互作用之致病機轉，包括病原體致病基因與宿主易感基因， 及與治療和癒後相關之基因體變異之鑑定及檢測分析。 3. 鑑定新興感染疾病的新興感染病原。 4. 微生物核酸之現場檢驗技術平台研發及應用。 5. 建立感染性疾病的動物模式，包含小鼠以及簡單物種 (線蟲及果蠅 ) ，並依此動物模式去 研究感染機轉以及評估治療策略。 6. 微生物基因體之單一分子定序分析及應用。 7. 微生物蛋白質之系統分析。 8. 細菌莢膜特異噬菌體之分離與或其莢膜醣解酶之選殖。/ 組織庫核心實驗室： 收集病理組織及提供病理技術服務為目的。 1. 組織收集：組織庫成立以來，已收集約 2000 件以上病理檢體，包含各類常見之癌症，因 為國家法律之改變，目前已將業務轉移至台大醫院生物資料庫，但組織庫成員仍協助其成 立相關作業。 2. 病理技術支援：組織庫設有冷凍切片機、臘塊切片機、免疫染色機、雷射微切儀及 qRT-PCR 機器，形成一平台，可由病理切片判讀做起，分析腫瘤組織蛋白質及核酸之表現。 基因剔除鼠核心實驗室： 本核心實驗室提供了關於基因剔除鼠產製相關的完整服務，除一般小鼠胚胎幹細胞株培 養、胚胎幹細胞基因標的、顯微注射、條件式與組織特異性基因剔除系統等基因剔除鼠相關 核心設施服務外，還提供剔除載體建構技術及大規模 Southern blotting服務。 實驗室目標為提供技術協助研究者製造下列基因剔除小鼠，包括： 1. 提供製造 knockout 小鼠服務，以供基因功能研究。 2. 協助製造 knock