国家973项目-抗体抗原分子识别结构基础和功能研究.doc

项目名称： 抗体-抗原分子识别的结构基础和功能研究 郭亚军 中国人民解放军第二军医大学 2010年1月-2014年8月 总后勤部卫生部 上海市科委 一、研究内容 拟解决的关键科学问题包括： 1. 抗体研究平台的系统性 抗体分子研究的一个重要条件是建立的抗体研究平台。目前采用生物学方法远远不能满足研究的需要。如何建立一个的研平台是本项目拟解决的一个关键问题。我们采用建立抗体“虚拟和验证”研究体系，发展和完善已建立的抗体研究生物技术平台。的空间分析与模型分析功能. 抗体抗原分子相互作用的规律性 抗体分子的一系列重要生物学功能均与抗体分子有紧密关系，对抗体分子规律的阐明，是本项目需要解决的重要关键科学问题。利用已建立的各种生物抗体库和抗体虚拟平台，抗体分子生物手段和生物信息技术，解析抗体分子的规律对抗体分子规律的阐明也将为其它生物大分子规律的研究奠定理论基础。——虚拟——模拟——生物的策略才有可能准确、全面地研究抗体分子识别的规律。 主要研究内容包括： 1．: 在生物信息大规模抗体虚拟库和抗体抗原分子识别的结构基础上，统计抗体抗原结合界面两侧的空间信息特征和特征，建立基于空间特征的蛋白质抗原空间表位预测方法，进行抗体抗原分子识别的分子动力学模拟，采用的空间分析与模型分析功能。2．： 运用结构生物学、计算生物学、免疫学、分子生物学生物化学的方法，以具有重要抗体分子抗体分子的三维结构 3. 抗体抗原复合物的分子分布特征及功能识别基础： 4．抗体分子规律： 利用有的，人—人单克隆抗体技术及小鼠杂交瘤技术收集所产生的功能性抗体分子数据，建立“生物抗体数据库”，结合学手段对研究，寻找抗体分子功能的规律。利用分子生物学、细胞生物学等方法对的抗体分子进行克隆和表达，在细胞或动物模型上研究抗体分子的生物学功能，对抗体分子进行系统研究二、预期目标 总体目标： 以建立的创新研究体系、寻找抗体分子为研究目标，本着“突出我国优势领域、着重解决符合重大需求的关键问题、瞄准国际基础理论前沿”的原则，在建立的生物信息学、生物大分子立体结构研究、数据挖掘技术以及抗体分子功能研究等技术平台上，建立抗体研究的创新体系，探讨适用于功能性抗体分子发现的通用性规律，争取获得源头创新性研究成果，加快我国生物信息学、计算和生物学的衔接和交叉，培养出一批高水平的各学科交叉型学术研究梯队。1．建立抗体分子的研究平台，开发并丰富生物信息学和计算生物学新算法模拟抗体进程，发现抗体分子的规律。 2．结合与交叉利用分子生物学，免疫学，结构生物学，计算机科学等众多相关领域的基础理论和技术，通过“”这一流程，建立抗原和抗体相互作用研究系统。 3．的生物信息数据库，通过理论模拟和数理统计方。采用和计算生物学等方法抽提推导抗体与抗原相互作用的规则或模式，从而虚拟出与抗原结合的抗体分子结构，用可视化手段进行。 4．对“虚拟”所得抗体分子采用生物技术实验手段进行克隆和表达，分析抗体分子与功能性抗原表位相互作用方式，在细胞和（或）动物模型上研究抗体分子的生物学功能，对抗体分子“虚拟体系”进行系统研究，找出抗体的通用性规律。 5．在SCI收录的学术期刊上发表论文0篇以上， 0篇发表在相关领域的国际权威刊物；取得具有国际影响的原创性学术成果-8项，申报发明专利项。 本研究以阐明“抗体分子与规律”为目标，采用技术平台，结合已拥有的抗体生物功能分析系统，组织学、结构生物学、功能基因组学、蛋白组学和免疫学等优势力量，开展多学科综合性研究。力图通过对抗体分子与规律的发现为快速寻找满足人们需要的特定功能的蛋白质（抗体）奠定理论基础。 本项目基于已建立的利用生物信息技术和库寻找适用于抗体分子通用性规律。 1）建立的研平台。的空间分析与模型分析功能采用建立抗体“虚拟和验证”研究体系，5）本项目可为已立项的重大基础研究项目，如免疫学、蛋白质组学、肿瘤学、干细胞等提供有利的支持。研究目标明确：在已建立生物信息学、生物大分子立体结构研究、数据挖掘技术以及抗体分子功能研究等技术平台，建立拥有自主知识产权的抗体分子与功能研究的创新体系，找出适用于功能性抗体分子的通用性规律，并将研究成果推广到其它的生物大分子的研究中，争取获得源头创新性研究成果，加快我国生物信息学、计算、蛋白质组学功能基因组学的衔接和交叉，培养出一批高水平的各学科交叉型学术研究梯队。 研究队伍：本项目的科研队伍主体均为来自国家及部门重点实验室的优秀中青年专家，国家杰出青年基金。组在、、生物信息学及抗体分子等领域积累了丰富的经验。 年来在相关研究领域取得的工作基础与积累为协作攻关奠定了基础：这些基础研究领域的突破为研究奠定了基础。上海市科委投入经费用于本项目相关。本项目的研究单位均具有优良的研究条件，并在、生物信息学及抗体分子研究领