调控机制依赖的能量消耗期刊.pdfVIP

第40卷 第4期 江西师范大学学报(自然科学版) Vo1．40No．4 2016年 7月 JournalofJiangxiNormalUniversity(NaturalScience) Ju1．2016 文章编号：1000-5862(2016)04-0338-08 调控机制依赖的能量消耗 杨喜艳，吴亚豪 (广东金融学院应用数学系，广东 广州 510521) p 摘要：基因表达是一个动态非平衡过程，必然要消耗能量．故从能量消耗的观点研究了转录水平上的一个 代表性的基因表达模型，此模型不仅考虑了复杂的启动子结构(有2个调控位点)，还考虑了相互作用转 r 录因子的功能(区分为招募、稳定和混合3种机制)．通过数学建模、理沦分析和数值模拟 ，研究发现：招募 机制最大化能量消耗 (定义为熵的产生率)，稳定机制最小化能量消耗 ，混合机制的作用介于2者之间． 此外显示出：当启动子活性态的转录率变化时，启动子活性与能量消耗之间呈现出反比关系，即启动子活 f 性越高(低)，能量消耗越少(多)；而当非活性态的转录率(或泄露率)变化时，启动子活性与能量消耗之 P 间呈现出正比关系，即启动子活性越高(-低)，能量消耗越多(少)．这些结果表明基因表达过程中的能量 消耗是调控机制依赖的． 关键词：基因表达；能量消耗；调控机制；启动子活性 中图分类号：0242；Q141；Q332 文献标志码：A DOI：10．16357／j．cnki．issnl000．5862．2016．04．02 e 等都是不可逆的，因而需要消耗能量．例如，通过对 l 0 引言 酵母菌的研究发现，能量消耗使得基因转录和翻译 o 的速率在可控制的范围之内 ．另有研究通过从高 生命活动必然要消耗能量．从生物体内物理功 磷酸盐模块中回收能量的做法，探测了基因表达过 i 能的实现 (如细胞运动…)到特定生物学功能的实 程中转录和翻译等基本生化反应所消耗的能量，即 现(如控制细胞周期的生化震荡 )，都需要消耗能 蛋白质的合成大约消耗90％的能量，而mRNA的转 量，蕴含着能量消耗存在于生命活动的所有层面．能 录过程需要不到 10％的能量 ¨．此外，许多其它的 g 量消耗在细胞系统中起着非常重要的作用，如增加 生化过程如转录因子作用、染色体重组以及DNA甲 特异性f3J、控制动力 J、减少变异 以及响应信 基化都需要消耗能量用以保证转录的特异性、保真 号 ．近年来，通过对感应一适应系统的研究发现，适 性和有效性” ． 应性状态的稳定 、短时间内强响应和长时间内精 众所周知，系统 中非平衡态机制的出现 (这意