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大连理l：人学硕七号搬论文
揍 要
在这篇论文曩，以辑叠速窭和天然结构已知昀22个两态小蛋自璇作为研究对象，
讨论了鬣白质韵折叠速率的对数与其基干结构酌丘然接触数之间的相关性随“接触”定
义中两参数的变化面变他的规律。结果褒明，巍炳个氨基酸在序列上拥隰12个氨基酸
以上，黼其c碳原子的赢线距离小于5．85埃辩，所研究的小鬣自酶拼叠速率的对数与
其天然接触数之间的线性相关性达到最大值，R=0．861。
孀分子动力学模叛方法研究了小螯自天然结构集合与其拼叠速发豹关系．根据蛋囱
质内存张接触的不同定义方式，利用分于动力学模拟方法得到了10个小蛋白的一系列
稳象集会，分褥了萁籀莽参数垮折叠速痍豹关系，并与PDB攀梅象酌情况遴纾了院较．
用含主链重原予的方式定义接触，所计算的结果较好，天然结构集合所计算的拓扑参数
每蛋自瓣辑叠邃瘦黪关系霹戳嚣真实翘菠浃实繇壤提．
蛋囱质折叠速率预测是当今生物物理学最舆挑战憾的课题之一近年来，该领域的
褥究取终了缀大戆进鼹，提出了诲多经验参数，壤知：接魑痔、长程序、总接触距离，链
拓扑参数、二级结构含激、有效长度、螺旋参数．n一阶接触距离等。这些参数都和蛋囱
壤的扳鬟速率煮缀驽数鞠关性，罄予这魑参数瓣嚣秒该测方法J箩}褥至4懿预测续桨也与突
验数据较好地吻合
关键词：小蛋白天然结构集合；二态小蚤白；折叠速率；蛋白质的天然接触数；枢关性
蛋融质的折叠速率与其天然接触彀2闻相关性的研究
the constantandthenumberofnative
between rate
Relationship folding
contactsofthe
proteins
Abstract
andnativestructureforasctOf22small
Inthis themeasuredrateconstant
paper,using
of
two-state theruleof betweenthetwo thecontacts
proteins，discusschan枣ng parameters
and ratesandnumberofnative
correlationofnatural ofthe
logarithmexperimentalfolding
than12 and
find the oftwoaminoacidsiSmore aminoacids
contact．Wethat．when
position
betweentheir is 5．85 linearcorrelation
the distance Ca tessthen
straight-line A，the
ofthenatural ofthe ratesandthenumberof
coefficient logarithmexperimentalfolding
is
residuesinthe the
proteinmax-val
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