基于高通量测序的石斑鱼循环水养殖生物滤池-ingentaconnect.pdfVIP

第 32 卷 增刊 1 农 业 工 程 学 报 Vol.32 Supp.1 242 2016 年 1 月 Transactions of the Chinese Society of Agricultural Engineering Jan. 2016 基于高通量测序的石斑鱼循环水养殖生物滤池微生物群落分析 1 1※ 2 1 1 1 3 黄志涛 ，宋协法 ，李 勋 ，万 荣 ，董登攀 ，石蓉蓉 ，翟介明 （1. 中国海洋大学水产学院海洋渔业系，青岛 266003 ； 2.青岛市黄岛区海洋与渔业局，青岛，266555 ； 3. 山东莱州明波水产公司，烟台 264000 ） 摘 要：为了解循环水养殖系统生物过滤器内微生物群落结构，明确其内部微生物的多样性。该文采用 Illumina-MiSeq 高通量测序技术对石斑鱼循环水养殖系统 3 级浸没式生物滤池内微生物群落结构及多样性进行分析。研究结果表明：3 个浸没式生物滤池的样品分别获得 712，635，865 个 Operational Taxonomic Unit (OTU)，共同包含的 OTU 为 488 个，其 中 3 号滤池的微生物群落丰富度和多样性高于 1 号和 2 号生物滤池，且 1 号生物滤池和 2 号生物滤池内微生物群落结构 相似度较高。在门的水平，3 个滤池以变形菌门 Proteobacteria 、拟杆菌门 Bacteroidetes 为优势菌；在属的水平，发现 3 个滤池中起硝化作用的细菌主要是亚硝化单胞菌 Nitrosomonas 和硝化螺菌 Nitrospira 。该试验为揭开生物滤池这个“黑匣 子”提供数据基础，对研究海水循环水养殖生物滤池的构建及其脱氮效率具有重要的指导意义。 关键词：养殖；微生物；污染；循环水养殖；浸没式生物滤池；微生物群落；高通量测序 doi ：10.11975/j.issn.1002-6819.2016.z1.033 中图分类号：S954 文献标志码：A 文章编号：1002-6819(2016)-Supp.1-0242-06 黄志涛，宋协法，李 勋，万 荣，董登攀，石蓉蓉，翟介明. 基于高通量测序的石斑鱼循环水养殖生物滤池微生物群落 分析[J]. 农业工程学报，2016，32(Supp.1)：242－247. doi ：10.11975/j.issn.1002-6819.2016.z1.033 Huang Zhitao, Song Xiefa, Li Xun, Wan Rong, Dong Dengpan, Shi Rongrong, Zhai Jieming. Analysis of microbial diversity of submerged biofilters in recirculating aquaculture system (RAS) for grouper (Epinehelus moara) based on high-throughput DNA sequencing[J]. Transactions of the Chinese Society of Agricultural Engineering (Transactions of the CSAE), 2016, 32(Supp.1): 242 －247. (in Chinese with English abstract) doi ：10.11975/j.issn.1002-6819.2016.z1.033 以对多样品的微生物群落结构进行大规模分析，能更精 0 引 言