基于形态特征和线粒体16srrna基因序列探讨棱鳀属-中国水产科学.pdfVIP

第17卷第3期 中国水产科学 Vol.17 No.3 2 0 1 0 年 5 月 Journal of Fishery Sciences of China May 2010 基于形态特征和线粒体16S rRNA 基因序列探讨棱鳀属的系统进化 1，2 2 2 2 2 2 1 马春艳 ，马凌波 ，倪勇 ，沈盎绿 ，张永 ，张凤英 , 赵云龙 （1. 华东师范大学 生命科学学院，上海 200062；2. 中国水产科学研究院 东海水产研究所，农业部海洋与河口渔业资源及生态 重点开放实验室，上海 200090） 摘要：对6种棱鳀属（ Cuvier 1829）鱼类共21个个体的16S rRNA基因进行PCR扩增，经比对校正得到572 bp的基 Thryssa 因片段，共检测到8个单倍型，棱鳀属6个种所有单倍型之间共存在8个插入 /缺失；此外有99个变异位点，其中简约信 息位点87个；多态位点比例为17.3%；序列中转换多于颠换，转换/ 颠换之比为 1.6；A + T含量（53.6%）明显高于C + G含 [ 量（46.4%），序列表现出明显的T偏倚。基于Kimura双参数法，计算的种间遗传距离介于0.4% 黄吻棱鳀（T. vitrirostris） ] [ ] 与中颌棱鳀（ ）到11.33% 黄吻棱鳀与赤鼻棱鳀（ ）之间。以日本鳀（ ）和欧洲 T. mystax T. kammalensis Engraulis japonius 鳀（ ）为外群构建的NJ树和ML树中，赤鼻棱鳀位于进化树的基部，是最早分化出来的种；进化树 Engraulis encrasicholus 显示，黄吻棱鳀和中颌棱鳀关系最近。本研究结果支持形态学得出的赤鼻棱鳀最先分化的结论，认为中颌棱鳀和黄吻 [ 棱鳀可能为同一个种，至于汉氏棱鳀（T. hamiltonii）和杜氏棱鳀 的分类地位有待进一步确认。 中国水 （ ） T. dussumieri 产科学，2010，17（3）：471-477] 关键词：线粒体DNA；16S rRNA；棱鳀属；系统进化 中图分类号：Q959　　　　　 　文献标识码：A　　 　　　　文章编号：1005-8737-（2010）03-0471-07 棱 鳀 属（ Cuvier 1829）隶 属 于 鲱 形 目 近年来分子系统学及DNA分子技术的快速发 Thryssa （Clupeiformes），鳀 科（Engraulidae），分 布 于 印 度-太 展，使得从分子水平研究鱼类物种间的亲缘关系及进 平洋。据报道，中国棱鳀属有6个种，即杜氏棱鳀