基于高通量测序的环状rna整体解决方案在心血管疾病研究中的应用.pdfVIP

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2017-09-04 发布于天津
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基于高通量测序的环状rna整体解决方案在心血管疾病研究中的应用

基于高通量测序的环状RNA整体解决方案在心血管疾病研究中的应用何铭辉 hmh@forevergen.cn 1 环状RNA生物学特征 2 环状RNA研究进展 3 环状RNA研究方案 1 环状RNA生物学特征 2 环状RNA研究进展 3 环状RNA研究方案环状RNA定义不具有5末端帽子和3末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子 viroid HDV Archaea red algae 产生机制--circRNA Cancer Lett. 2015 Sep 1;365(2):141-8 环状RNA细胞内定位 Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8 Nat. Struct. Mol. Biol, 22 (2015), pp. 256–264 竞争性内源RNA功能 Cancer Lett. 2015 Sep 1;365(2):141-8 对线性RNA的调控 Cancer Lett. 2015 Sep 1;365(2):141-8 1 环状RNA生物学特征 2 环状RNA研究进展 3 环状RNA研究方案发现之旅 “假像” 重要调控功能 1991年 2013年 Nature. 2013 Mar 21;495(7441):333-8 PLoS Genet. 2013;9(9):e1003777 动脉粥样硬化研究转录组测序环状RNA的鉴定 PLoS Genet. 2010 Dec 2;6(12):e1001233 动脉粥样硬化研究 PLoS Genet. 2010 Dec 2;6(12):e1001233 环状RNA数据库 1 环状RNA生物学特征 2 环状RNA研究进展 3 环状RNA研究方案研究整体解决方案适用研究类型：动脉粥样硬化、高血压、冠心病、脑血栓、血管缺氧反应等研究课题上游鉴定高通量测序己有转录组数据/数据库挖掘己知特定环状RNA 临床标本验证过表达实验（gain of function ）；功能缺失实验（loss of function）；功能机制研究细胞实验；动物模型；下游信号通路研究实验建库 Sequencing library RNA isolation rRNA depletion circRNA enrichment