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东海表层沉积物纯培养与非培养细菌多样性-化学反应工程与工艺
生物多样性 2013, 21 (1): 28–37 Doi: 10.3724/SP.J.1003.2013.10097
Biodiversity Science http: //
东海表层沉积物纯培养与非培养细菌多样性
何建瑜 刘雪珠 赵荣涛 吴方伟 王健鑫*
(浙江海洋学院海洋生物资源与分子工程实验室, 浙江舟山 316000)
摘要: 于2011年7月采集了浙江舟山沿岸海底沉积物样品(122°10′41″ E, 29°49′7″ N), 通过埋片原位观察、荧光显微
计数、纯培养菌分离以及非培养细菌构建克隆文库的方法, 分析和研究了东海表层沉积物细菌群落结构及其多样
性。埋片原位观察和荧光显微计数法的结果表明: 沉积物样品中细菌的细胞数量为(9.30±3.44) ×107 cells/g; 通过分
离纯化共获得313株细菌, 分属于20个属, 4种培养基对细菌的分离效果依次为ROM1Zobell 2216MR2A; 常规
形态学与生理生化鉴定结果显示芽孢杆菌属(Bacillus)和海球菌属(Marinococcus)从数量和种类上皆为优势菌属,
分别占分离菌株总数的21.08%和17.25%; 对73株典型海洋细菌进行16S rDNA分子鉴定发现, 厚壁菌门(57.5%)、γ-
变形杆菌纲(32.9%)、黄杆菌纲(4.1%)和放线菌纲(5.5%)等为主要类群。非培养细菌克隆文库序列分析发现: 细菌
克隆子主要属于厚壁菌门和变形杆菌门, 而芽孢杆菌纲和γ-变形杆菌纲是上述两个门的优势类群。综合纯培养与
非培养数据得出东海海域表层沉积物细菌多样性丰富, 具有进一步开发研究的价值。
关键词: 东海海域, 海洋细菌, 16S rDNA, 群落结构, 多样性
Diversity of cultured and uncultured bacteria in surface layer sediment
from the East China Sea
*
Jianyu He, Xuezhu Liu, Rongtao Zhao, Fangwei Wu, Jianxin Wang
Laboratory for Marine Living Resources and Molecular Engineering, Zhejiang Ocean University, Zhoushan, Zhejiang
316000
Abstract: Marine bacteria are an extremely important component of marine bioresources. We studied the
community structure and diversity of cultured and uncultured bacteria in surface layer sediment sampled
from the East China Sea (122°10′41″ E, 29°49′7″ N) by buried piece observation, fluorescence enumeration,
pure
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