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matlab中主成分分析的函数1
matlab中主成分分析的函数
princomp功能:主成分分析 格式:PC=princomp(X)???????[PC,SCORE,latent,tsquare]=princomp(X)
说明:[PC,SCORE,latent,tsquare]=princomp(X)对数据矩阵X进行主成分分析,给出各主成分 (PC)、所谓的Z-得分(SCORE)、X的方差矩阵的特征值(latent)和每个数据点的Hotelling)T2统计量(tsquare)。pcacov函数
功能:运用协方差矩阵进行主成分分析??? 格式:PC=pcacov(X)???? [PC,latent,explained]=pcacov(X)
说明:[PC,latent,explained]=pcacov(X)通过协方差矩阵X进行主成分分析,返回主成分(PC)、协方差矩阵X的特征值(latent)和每个特征向量表征在观测量总方差中所占的百分数(explained)。pcares函数
功能:主成分分析的残差格式:residuals=pcares(X,ndim)说明:pcares(X,ndim)返回保留X的ndim个主成分所获的残差。注意,ndim是一个标量,必须小于X 的列数。而且,X是数据矩阵,而不是协方差矩阵。barttest
功能:主成分的巴特力特检验格式:ndim=barttest(X,alpha)????? [ndim,prob,chisquare]=barttest(X,alpha)
说明:巴特力特检验是一种等方差性检验。ndim=barttest(X,alpha)是在显著性水平alpha下,给出满足数据矩阵X的非随机变量的n维模型,ndim即模型维数,它由一系列假设检验所确定,ndim=1表明数据X对应于每个主成分的方差是相同的;ndim=2表明数据X对应于第二成分及其余成分的方差是相同的。
主要变量数据,进行主成分分析
表:2007年各地区农村居民家庭平均每人生活消费支出(单位:元)
地区 食品 衣着 居住 家庭设备及服务 交通和通讯 文教娱乐用品及服务 医疗保健 其它商品及服务 北京 天津 重庆 [x,textdata]=xlsread(‘A.xls’);%从excel中读取数据
Xz=zscore(x) % 数据标准化
[PC,SCORE,latent,tsquare]=princomp(Xz)
%利用princomp函数根据标准化后原始样本观测数据作主成分分析,返回主成分表达式的系数矩阵PC, 主成分得分数据SCORE,样本相关系数矩阵的特征值向量latent和每个的Hotelling)T2统计量(tsquare)。latent/sum(latent)%计算贡献率
[m,n]=size(x)%求x的行数和列数
result1=cell(n+1,4);%定义一个n+1行,4列的元胞数组
result1(1,:)={特征值,差值,贡献率,累积贡献率}
result1(2:end,1)))))‘地区’,总支出,第一主成分得分y1,第二主成分得分y2’}
result3(2:end,1))’ko’)%绘制两个主成分得分的散点图
xlabel(‘第一主成分得分‘),
ylabel(‘第二主成分得分‘)
gname(cityname)%交互式标注每个地区的名称
%根据霍特林T^2统计量寻找极端数据
result5=sortrows([cityname,num2cell(tsquare)],2)
%转为胞元数组,并按第二列排序
[{‘地区‘,’霍特林T^2统计量‘;result5}
练习:应用MATLAB内部的数据cities.mat进行分析。该数据是美国329个城市反映生活质量的9项指标的数据。这9项指标分别为:气候、住房、健康状况、犯罪、交通、教育、艺术、娱乐和经济。
例2:从协方差矩阵或相关系数矩阵出发求解主成分
表:128名成年男子身材的六项指标的相关系数矩阵
变量 身高(x1)];%输入相关系数矩阵
[PC,latent,explained]=pcacov(PHO)%相关系数矩阵进行主成分分析,返回主成分(PC)、矩阵的特征值(latent)和每个特征向量表征在观测量总方差中所占的百分数(explained)。))))’’坐高(x2)’;’ 胸围(x3)’;’ 手臂长(x4)’;’肋 围(x5) ’;‘腰围(x6)’}
result1(:,1))‘主成分prin1,主成分prin2, 主成分prin3};
result2(2:end,1))$表达式的系数数据
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