动物遗传学-第九章+的动物基因组学.ppt

第九章 动物基因组学 （Animal Genomics）;一、什么是人类基因组计划？;二、为什么启动人类基因组计划？;三、人类基因组计划的研究进展;多国合作小组2001年在Nature上公布结果 Craig Venter博士采用鸟枪法于Science上发表结果。 人基因组测序的完成可与人类登月媲美。;耗时 10 载，耗费 30 亿美元； 基因组大小 30亿 碱基，其中中国承担 1% 的测序任务。 1 %为外显子， 99 %为内含子和重复序列； 表达蛋白质的基因组数量约为 3 万； 约含 100百万 个SNP标记。;序列测定方法 1;序列测定方法 2;五、人类基因组计划的意义;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;基因组大小的比较（1）;基因组大小的比较（2）;六、其它物种基因组;第二节 基因组学及蛋白质组学;（一） 基因组学的分类;结构基因组学;2 毛细管电泳：可用于单核苷酸改变的寻找，短串联重复序列的检查，DNA测序，基因及其表达产物的分析。 3 基因芯片技术：可用于表达谱测定、突变检测、多态性分析、基因组文库作图和杂交测序等。 4 全基因组随机测序（全基因组鸟枪战略）：先打断DNA测序，然后作图。 ;功能基因组学;3、功能基因组学研究的方法;生物芯片 ;生物芯片 ;（二）比较基因组学;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.; ; 蛋白组（Proteome） 蛋白质组是指“一种基因组所表达的全套蛋白质”。 蛋白组学（Proteomics） 一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科。 蛋白组学与功能基因组学息息相关。 ;1.蛋白质分离和鉴定：2.翻译后修饰：翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定：如分析酶活性和确定酶底物，细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。4.对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子，很多药物本身就是蛋白质，而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。;蛋白质组学研究方法;第三节 基因图谱 （gene map）;一、遗传图谱：又称连锁图谱(linkage map)，; 现代遗传图的概念是于1980年提出的，就是将单纯的表型多态性界标改变为以DNA序列的多态作为作图界标。 各种遗传界标可在国际互联网上可以查阅（）。 当用DNA序列多态作为界标的遗传图时，一但确定该DNA界标与某一基因的具体位置，便可分离克隆这个基因。 人类第一张以RFLP为界标的遗传图发表于1987年。;遗传图的局限性;二、物理图谱（physical map);Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.; ;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;第三节 生物信息学 （Bioinformatics）;背景知识;生物信息学是以生物大分子为研究对象，以计算机为工具，运用数学和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈指数级增长的生物信息数据的一门科学.;主要研究内容 ;3、功能基因组相关信息分析 包括与大规模基因表达谱分析相关的算法、软件研究，基因表达调控网络的研究；与基因组信息相关的核酸、蛋白质空间结构的预测和模拟，以及蛋白质功能预测的研究。 4、生物大分子结构模拟和药物设计 包括RNA(核糖核酸)的结构模拟和反义RNA的分子设计；蛋白质空间结构模拟和分子设计；具有不同功能域的复合蛋白质以及连接肽的设计；生物活性分子的电子结构计算和设计；纳米生物材料的模拟与设计；基于酶和功能蛋白质结构