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荧光定量PCR的原理嫉陌应用
;荧光定量PCR仪的应用;Evaluation only.
Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile .
Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;PCR的反应过程;实时荧光定量PCR ;实时荧光定量PCR中的三个概念;增长曲线 反映荧光强度与循环数的对应关系;域值:PCR扩增信号进入相对稳定对数增长期时的荧光值。;Ct值
Ct值:C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。;Ct值与起始模板的关系
每个模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。起始拷贝数越多, CT值越小;模板DNA的起始拷贝数越少,CT值越大。
一般正常的CT值范围在15-35之间,过大和过小都将影响实验数据的精度。; 荧光定量PCR标记方法
内掺式染料
SYBR Green I
序列特异性探针
Taqman
Molecular Beacons
Dual Probes(FRET)
引物特异性探针
Amplifluor (Intergen);5’;5’;SYBR Green? I;熔解温度(Tm值);Melt Curve Analysis;R;优点:
对目标序列有很高的特异性,在病原微生物特异性检测上有独特优势
设计简单,准确性好
缺点:
只适合于一种特异目标的检测,相对价格略高;荧光定量PCR实验技术路线;引物设计的一般原则:
产物长度在80-300bp之间
产物GC含量在50-60%之间
引物的GC含量在50-60%之间,熔解温度在55-65℃之间
应避免引物中有连续的G或C,但推荐在引物的末端含有G或C
Primer 5.0
/Scitools/Applications/PrimerQuest/Default.aspx?SequenceWarning=True
;荧光定量PCR实验技术路线;荧光定量PCR实验技术路线;荧光定量PCR实验技术路线;定量方法;;绝对定量;相对定量——在一定样本中靶基因相对于另一参照样本的量的变化 ;比较CT法( △△CT )
前提:每个循环增加一倍的产物数量,靶基因和看家基因的扩增效率基本一致
双标准曲线法
利用两组标准曲线分别得到目的基因及持家基因的表达量
样本目的基因表达量=
;目标基因与持家基因扩增效率差别举例 ;相对定量方法二——双标准曲线法;谢 谢 !
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