DNA甲基化与基表达调控研究进展.pdfVIP

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１３，３３（７）：９０９６ ＤＮＡ甲基化与基因表达调控研究进展 １ ２ １ 史玉杰 　李庆贺 　刘晓辉 （１中国农业科学院植物保护研究所　北京　１００１９３　２中国农业大学生物学院　北京　１００１９３） 摘要　表观遗传修饰是指不改变ＤＮＡ序列的、可遗传的对碱基和组蛋白的化学修饰，主要包括 ＤＮＡ甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑以及非编码ＲＮＡ等。表观遗传修饰是更高层次的基因表 达调控手段。ＤＮＡ甲基化是一种重要的表观遗传修饰，参与基因表达调控、基因印记、转座子沉 默、Ｘ染色体失活以及癌症发生等重要生物学过程。近年来随着研究方法和技术的进步，全基因 组ＤＮＡ甲基化的研究广泛兴起，多个物种全基因组甲基化图谱被破译，全局水平对ＤＮＡ甲基化 的研究不仅利于在宏观层面上了解ＤＮＡ甲基化的特性与规律，同时也为深入分析ＤＮＡ甲基化的 生物学功能与调控奠定了基础。结合最新研究进展综述ＤＮＡ甲基化在基因组中的分布模式、规 律以及和基因转录的关系等。 关键词　ＤＮＡ甲基化　基因组　基因表达调控 中图分类号　Ｑ７５ 　　ＤＮＡ甲基化是指在ＤＮＡ甲基转移酶的催化下，以 的检测。近年来随着高通量测序技术和 ＤＮＡ芯片技 硫代蛋氨酸为甲基供体，在 ＣｐＧ二核苷酸的胞嘧啶分 术的发展，使得分析全基因组ＤＮＡ甲基化图谱成为可 子的５′碳原子上添加一个甲基基团的化学修饰。ＤＮＡ 能。２００３年１０月，人类表观基因组计划委员会正式宣 甲基化是重要的表观遗传修饰之一，在大多数真核生 布投资和启动人类表观基因组计划（ｈｕｍａｎｅｐｉｇｅｎｏｍｅ 物中广泛存在，但在一些真核生物如酿酒酵母 ｐｒｏｊｅｃｔ，ＨＥＰ）。ＨＥＰ的主要目标是研究人类所有基因 （Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）和 秀 丽 隐 杆 线 虫 在主要组织以及２００多种细胞中正常和疾病状态下的 （Ｃａｅｎｏｒｈａｂｄｉｔｉｓｅｌｅｇａｎｓ）中目前尚未检测到 ＤＮＡ甲基 甲基化模式，并在基因组水平绘制不同组织正常和疾 ［１２］ ［７］ 化的存在 。虽说绝大多数ＤＮＡ甲基化发生在 ＣｐＧ 病状态时的甲基化变异位点图谱 。２００８年，美国癌 二核苷酸上，但有研究表明在植物、小鼠胚胎和胚胎干 症研究协会启动 ＡＨＥＡＤ计划（ａｌｌｉａｎｃｅｆｏｒｔｈｅｈｕｍａｎ 细胞及人的胚胎干细胞中，在ＣＨＧ和ＣＨＨ（Ｈ为Ａ，Ｔ ｅｐｉｇｅｎｏｍｅａｎｄｄｉｓｅａｓｅ），旨在解析人、小鼠、水稻以及拟 ［８］ 或Ｃ任一核苷酸）等三联体核苷酸的第一个胞嘧啶的５′ 南芥、酵母、果蝇和线虫等模式生物的表观基因组 。 ［３６］ 碳原子上也能够发生甲基化修饰 。人类基因组中约 本文结合近年来的ＤＮＡ甲基化研究文献，综述了ＤＮＡ ３％～６％的胞嘧啶是甲基化的，而在植物基因组中由于 甲基化在基因组中的分布规律、不同物种ＤＮＡ甲基化 重复序列比例的升高，甲基化胞嘧啶的比例可能更高。 模式的比较以及 ＤＮＡ甲基化对基因表达调控等方面 　　ＤＮＡ甲基化水平受到环境、疾病、年龄和性别等因 的最新进展。 素的影响，处于动态的变化过程中。不同的细胞、组织 １　ＤＮＡ甲基化在基因组中的分布模式 或个体之间，甚至同一细胞或个体的不同发育时期，其 ＤＮＡ甲基化状态和程度都可能存有差异。长期以来由 　　ＤＮＡ甲基化在生物体内的分布并不是随机的，而 ＤＮＡ甲基化的研究局限于特定基因或 是呈现一定的规律性。如在许多基因的５