微卫星标记和猪部分肉质性状相关地分析.pdfVIP

微卫星标记作为一种重要的分子标记，其遗传稳定、且信息量大，许多多态 性标记在非编码区，表现为选择“中性”，不受内外环境的影响，与基因的表达与 否无关，检测迅速，操作简便，费用低廉。 微卫星多态性与传统的血型、蛋白质多态相比，多态性更好。微卫星标记与 其他分子标记如RFLP、RAPD、AFLP等相比，具有基因组中含量丰富且分布均匀 等优点，多态性好的特点，而且其呈简单的孟德尔共显性遗传，可以直接由带型 来区分基因型，统计分析相对较简单，试验过程中结果可靠，重复性好，操作也 比较简单，检测速度快，试验周期短。目前已有的猪、牛、羊、禽等畜禽的基因 图谱主要是以微卫星为基础而构建的，微卫星标记在染色体上的相对位置都已经 确定，越为微卫星的利用带来了方便。另外，微卫星的等位基因数和多态程度都 可以通过文献和互联网查到，这些都为实验的开展以及微卫星标记的筛选及引物 的合成提供了大量有用的信息和便利。比起传统的遗传育种技术来，节省了大量 的时间和费用。对于遗传力低的性状进行选择，与常规方法相比避免了遗传进展 缓慢，且难以精确估测控制数量性状座位(OTL)基因效应的缺点，加快了改良速度 和新品种的培育进程。 1．4 微卫星在猪遗传育种中的应用现状 1．4．1构建基因图谱 基因图谱包括遗传图谱和物理图谱，遗传图谱标明的是细胞在减数分裂时基 因座位之问发生重组的频率，而物理图谱标明的是基因座位在染色体上的具体位 置。遗传图谱以具有多态性(即具有多个等位基因)的遗传标记为工具，遗传图谱 是重要经济性状基因定位和标记辅助选择技术的基础，而物理图谱是位置克隆和 体外操纵重要经济性状基因的基础。利用微卫星构建基因连锁图谱的基本思路是： 以微卫星为基础，在基因组中每隔一定的距离找到1个多态性微卫星标记，当这 些标记达到一定饱和度时(平均间隔不大于20cM并覆盖90％以上基因组)便可由此 绘制出一个基本的遗传连锁图谱，同时即可借助这些微卫星标记找到基因组中任 何控制表型的功能基因或盯L，并对其进行操作和利用。完整的猪基因组大约由 28亿碱基对组成，到2002年1月9日为止，罗斯林研究所猪基因组数据库中的位点 2 以20cM左右距离均匀筛选了分布于6号染色体的9个多态性微卫星位点，构建了 猪6号染色体的遗传连锁图谱。9个微卫星位点均为中、高度多态性位点，所有位 总长198．6cM，与USDA图谱位点顺序一致。对数量性状位点的进一步定位研究发 现，在6号染色体存在显著影响肌内脂肪、肌肉大理石纹等肉质性状和板油重的数 别选用7和8个微卫星位点，应用CRIMAP软件，构建出了猪4号和7号染色体的连锁 图谱。 1．4．2重要经济性状(QTL)定位方面的应用 对重要经济性状进行选育必须建立在对其基因进行精确定位的基础上，由于 微卫星良好的多态性，因而在OTL定位方面得到了广泛的应用。目前大量影响猪 重要经济性状的主基因或OTL在不同染色体上都已得到了检测。如许多与猪生长 和肌肉品质相关的QTL被定位在6号上，另外许多影响胴体、肉质性状的候选基因 也被定位在6号染色体上，如兰呢啶受体基因等。目前定位QTL的方法主要有：候选 资源家系，根据F代群体中分离情况鉴定凹Ls，在猪4号染色体上发现存在影响平 扫描18对常染色体和x染色体，结果发现：影响排卵率、初情期、乳头数、死胎 数、初生活仔数的QTL分别位于9号染色体、7号和8号染色体、8号和11号染色体、 微卫星进行基因组扫描，在I号染色体长臂端粒附近SW373和SWl301之间发现存在 显著影响5．5～56kg体重阶段平均日增重的QTL，该凹L在F：代的表型方差中占到 26％，并且对出生至56kg体重的平均日增重有显著影响。 1．4．3标记辅助选择(MAS)方面的应用 传统的遗传育种技术提高改良重要经济性状需要较长的时fBJ和费用，特别是 对遗传力低的性状进行选择，遗传进展缓慢，且难以精确估测此类数量性状座位 (町L)的遗传效应。而采用微卫星标记进行标记辅助选择则能取得以往常规方法 所不能获得的效果，使用微卫星标记，通过连锁分析，将复杂性状定位到基因组的 特定染色体区段内，通过标记辅助选择(MhS)来加速改良速度和新品种的培育进 程。如果找到了与性状紧密连锁的分子遗传标记，利用该标记进行标记辅助选择 将会快速提高生产性能。利用微卫星标记与主基因或叩L的紧密连锁，通过跟踪 标记就能达到间接选择的目的，连锁程度越高，则效果越好。Kim等(2000