第二章蛋白质工程,档陌白质设计.ppt

蛋白质与酶工程;第二章 蛋白质分子设计;蛋白质分子设计;蛋白质分子设计;第一节 蛋白质分子设计原理;一、蛋白质分子设计的分类（一）蛋白质分子设计的层次;一、蛋白质分子设计的分类;（二）蛋白质分子设计分类;二、蛋白质分子设计的基础;总结;;二、蛋白质分子设计的基础;抹香鲸肌红蛋白（Myoglobin）的三级结构;02与肌红蛋白的结合;血红蛋白的结构;血红蛋白的三维结构;图 血红蛋白α链和β链和肌红蛋白构象的相似性;氧合血红蛋白显著改变Hb的四级结构;作为动态构象分子，血红蛋白可以看作是αβ-二聚体的二聚体，也可以看作是相同的二聚体半分子组成：α1β1-亚基和α2β2-亚基对。每个αβ-二聚体作为钢体移动。当血红素基氧合时，分子的两个二聚体半分子彼此滑动。如果一个αβ-二聚体固定不动，则另一个αβ-二聚体将绕一个设想的αβ-二聚体的偏心枢轴旋转约15°并平移0.08nm。;氧合血红蛋白和去氧血红蛋白代表不同的构象态;二、蛋白质分子设计的基础; 计算机模拟;三、蛋白质分子设计原则;三、蛋白质分子设计原则;三、蛋白质分子设计原则;三、蛋白质分子设计原则;三、蛋白质分子设计原则;三、蛋白质分子设计原则;四、蛋白质分子设计的程序;四、蛋白质分子设计的程序;四、蛋白质分子设计的程序;四、蛋白质分子设计的程序;四螺旋束;N;四、蛋白质分子设计的程序;四、蛋白质分子设计的程序;四、蛋白质分子设计的程序;例：蛋白质突变体设计步骤;注意问题;蛋白质设计原则掌握;④ 疏水及亲水基团需要合理地分布在溶剂可及表面及不可及表面。 ⑤ 在金属蛋白中，配位残基的替换要满足金属配位几何。 ⑥ 对于金属蛋白，围绕金属中心的第二壳层中的相互作用是重要的。 ⑦ 最优的氨基酸侧链几何排列。 ⑧ 结构及功能的专一性。形成独特的结构，独特的分子间相互作用是生物相互作用及反应的标志。;蛋白质分子设计流程图;蛋白质分子设计大致涉及的几个重要方面;蛋白质分子设计大致涉及的几个重要方面;蛋白质分子设计大致涉及的几个重要方面;蛋白质三维结构知识的必要性;第二节 基于天然蛋白质结构的分子设计 ;;一、定位突变;一、定位突变（一）定位突变的设计目标及解决办法; 设计目标;（二）定位突变种类;（二）定位突变种类;（二）定位突变种类;限制性内切酶;（三）定位突变的程序;结构与功能的容忍度;（四）定位突变残基的鉴定;（五）定位突变的应用T4 lysozyme;（五）定位突变的应用;Stabilizing the dipoles of ? helices increases stability (contd.);二. 蛋白质分子拼接;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;第三节 全新蛋白质设计;蛋白质的全新设计内容;第三节　全新蛋白质设计;第三节　全新蛋白质设计;第三节　全新蛋白质设计;第三节　全新蛋白质设计;二、蛋白质结构的从头设计;二、 蛋白质结构的从头设计;１．二级结构的设计原则;;２．配体诱导组装;３．通过共价交叉连接实现肽的自组装;４．在合成模板上肽的组装;５．线性多肽折叠为球状结构;６．基于组合库的全新蛋白质设计; 三、蛋白质功能的全新设计;蛋白质的功能设计;