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2009并行计算及多核程序设计17-18OpenMP研讨课
* 研讨话题 OMP与多线程的效率对比 * 研讨话题 结合高性能计算实例，分析OMP对核的利用率 * 超级计算机Super Computer 厂家 IBM、HP / 用途 需要大量运算的工作，如天气预测、气候研究、运算化学、分子模型、物理模拟、密码分析等等 超级计算机操作系统 UNIX变种 提高系统的资源利用率 编程语言 由于Fortran运行比C或C++的更快，所以被选用作科学编程 标准的应用编程接口（如信息传递接口及并行虚拟机器） * 魔方（曙光5000A）超级计算机系统软件 采用基于多核CPU的星群体系结构 支持OpenMP（节点内）、MPI以及两者混合编程 三种编译器均支持OpenMP GNU GCC 支持C, C++, Objective-C, Fortran, Java等 -fopenmp Intel编译器套件 支持C/C++，F77/F90/F95，HPF，Java -mp PGI编译器套件 为Portland公司，支持C/C++，F77/F90/F95，HPF，Java -openmp * 全机系统被分成三个部分即A、B、C三个区域 A区由82个机架式服务器构成 主要部署各类工程计算商业软件，每个服务器含8个 AMD Barcelona 1.9GHz低功耗型Opteron 8347HE四核处理器，128GB共享内存，InfiniBand光纤网络互联； B区由650个刀片式服务器组成，主要用于各种源代码类计算，每个服务器含4个AMD Barcelona 1.9GHz 低功耗型 Opteron 8347HE 四核处理器，64GB共享内存，InfiniBand光纤网络互联； C区由800个刀片式服务器组成，主要用于各种源代码类计算，每个服务器含4个AMD Barcelona 1.9GHz低功耗型Opteron 8347HE四核处理器，InfiniBand光纤网络互联，其中300个刀片含32GB共享内存，500个刀片含64GB共享内存。 * * 串行任务 共享内存并行作业 Openmp 同一个节点内 消息传递方式MPI并行作业 OpenMP+MPI混合并行作业 通常情况下可以采用每节点上的16个核心，分为四组，每组由一个MPI进程，产生并管理四个OpenMP线程的配置。 * 研讨话题 结合高性能计算实例，分析OMP对核的利用率 * 谢谢 * Script: Here is another look at the same example – but emphasizing the potential performance payoff from this sort of pipelined approach that we get from using tasks. First off, observe that in single threaded mode, all tasks are done sequentially – Block1 is calculated ( node p is assigned to head), then block 2 (pointer p is processed by process(p), then block 3 ( reads next pointer in the linked list), then repeating Blocks2, block 3 etc. 1st animation Now consider the same code executed in parallel First, the master thread crosses the omp parallel construct and creates a team of threads. Next one of those threads is chosen to execute the while loop – lets call this thread L Thread L encounters an omp task construct at block 2 which copies the code and data for process(p) to a new task – well call it Task1 The thread L increments the pointer p – grabbing a new node from the list, and loops to the top of the while loop Then thread L again encounters an omp task construct at block 2
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