中国部分地区蝙蝠带病毒的宏基因组学分析.PDF

586 杨凡力 等/ 中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析 生 物 工 程 学 报 Chinese Journal of Biotechnology May 25, 2013, 29(5): 586−600 /cjbcn ©2013 Chin J Biotech, All rights reserved 动物及兽医生物技术 中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析 1,2 3 4 2 5 2 2 2 3 杨凡力 ，王意银 ，郑文成 ，何彪 ，江廷磊 ，李莹莹 ，夏乐乐 ，冯烨 ，范泉水 ， 涂长春2 1 吉林大学畜牧兽医学院，吉林 长春 130062 2 军事医学科学院军事兽医研究所，吉林 长春 130122 3 成都军区疾病预防控制中心，昆明 云南 650118 4 湖南省动物卫生监督所，长沙 湖南 410007 5 东北师范大学吉林省动物资源保护与利用重点实验室，吉林 长春 130024 杨凡力, 王意银, 郑文成, 等. 中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析. 生物工程学报, 2013, 29(5): 586−600. Yang FL, Wang YY, Zheng WC, et al. Metagenomic analysis of bat virome in several regions of China. Chin J Biotech, 2013, 29(5): 586−600. 摘 要: 蝙蝠携带有60 多种病毒，其中许多对人有高度致病性。为了解中国蝙蝠携带病毒的自然本底、蝙蝠 病毒的多样性和挖掘潜在的病毒病原，通过基于 Solexa 高通量测序的病毒宏基因组学技术对从吉林、云南、 湖南采集的蝙蝠组织进行病毒组学研究，获得了 11 644 232 条读长 (Reads) ，并拼接出 44 872 条重叠序列 (Contig) 。通过核酸序列注释发现，其中8.2 ％ (4 002/44 872) 的重叠序列与病毒相关，能进一步注释到36 个 病毒科，包括 19 种脊椎动物病毒、6 种植物病毒、4 种昆虫病毒和4 种噬菌体。通过对重叠序列的遗传进化分 析、多序列比对显示，被注释为细小病毒、腺联病毒、博卡病毒、腺病毒、小双节RNA 病毒等的重叠序列与 已知病毒相似，部分序列却又呈现出明显的序列差异。通过对腺病毒和博卡病毒进一步的PCR 扩增证实了 此研究方法可靠。旨在了解我国蝙蝠携带病毒组的构成，对建立高效的野生动物源人兽共患病的监测方法提供 参考。 关键词: 病毒宏基因组学，蝙蝠，病毒组，高通量测序 Received: December 19, 2012; Accepted: March 5, 2013 Supported by: NSFC-Yunnan Province Joint Fund (No. U1036601). Corresponding author: Changchun Tu. Tel/Fax: +86-431 E-mail: changchun_tu@ NSFC 云南省联合基金 (No. U1036601) 资助。 网络出版时间：2013-04-10 网络出版地址：/kcms/detail/11.1998.Q1005.003.html 杨凡力 等/ 中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学