淀粉纤维蛋白错误折叠机理的理关于的分析研究.pdfVIP

万方数据 万方数据 淀粉状纤维蛋白错误折叠机理的理论研究 淀粉纤维蛋白错误折叠机理的理论研究 摘 要 淀粉纤维在退行性疾病中扮演着重要的角色，包括老年痴呆症，II 型 糖尿病，海绵状脑组织病，以及阮病毒引起的疾病等。相关蛋白的错误 折叠将导致淀粉纤维。而目前关于这些纤维的形成机制仍然不是非常清 楚。 本论文利用分子动力学模拟（MD）手段分析了八类六肽的六聚体的稳 定性，寻找淀粉纤维聚集的关键因素。MD 的结果显示，八类六聚体中 VEALYL 和 MVGGVV-1 的稳定性是最高的，然后是 SNQNNY，以及 LYQLEN, MVGGVV-2, VQIVYK, SSTSAA, GGVVIA。统计学数据显示，疏水性氨基酸 残基对于稳定六聚体内部 zipper 结构起着重要的作用。MVGGVV-1 的单 点突变和双突变实验发现 1 号 Met 与 2 号 Val 是重要的疏水残基，这与 之前的统计分析的结果是一致的。MVGGVV-1 的各种低聚体的稳定性分析 表明，其成纤维的中间状态结构可能是三聚体（3-0）或者四聚体（2-2） 的形式。 我们还对比较稳定的VEALYL 进行了单点突变和双突变实验研究，证实 了一号Val 是稳定体系的关键残基，而各类多聚体的稳定性分析也表明， 万方数据 淀粉状纤维蛋白错误折叠机理的理论研究 VEALYL 成纤维的中间结构可能为三聚体（3-0）的形式。这些研究理解 淀粉纤维蛋白的形成机理具有重要的意义，而且这些方法也同样适用于 其它淀粉纤维蛋白的稳定性研究。 关键词：淀粉纤维，错误折叠机制，突变，稳定性，多聚体 万方数据 淀粉状纤维蛋白错误折叠机理的理论研究 THEORETICAL RESEARCH OF THE MISFOLDING MECHANISM OF AMYLOID FIBRIL ABSTRACT Amyloid fibrils are considered to play causal roles in the pathogenesis of amyloid-related degenerative diseases such as Alzheimer’s disease, type II diabetes mellitus, the transmissible spongiform encephalopathies, and prion disease. The mechanism of fibril formation is still hotly debated and remains an important open question. In this study, we utilized molecular dynamics (MD) simulation to analyze the stability of hexamer for eight class peptides. The MD results suggest that VEALYL and MVGGVV-1 are the most stable ones, then SNQNNY, followed by LYQLEN, MVGGVV-2, VQIVYK, SSTSA