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并行计算蛋白质序列比对的并行处理路保同级计算机菁英班一读程序开始计时计时结束一读程序函数蛋白质序列比对函数从数据库中取下一条序列计算查询序列与数据库中某条序列对比的得分在得分大于时插入得分链表取下一条序列二实验思路串行每一条待测序列要和数据库中的每条序列进行比较计算得分如何实现并行化对于一条待测序列同时与数据库中多个序列进行比较计算得分关键问题数据库划分静态划分将数据库全部入内存数据库划分动态划分获取一下块时注意互斥访问动态划分静态划分动态划分负载更加均衡互斥锁静态划分不需要互斥锁一次性划分负载
并行计算Project
——蛋白质序列比对的
并行处理
路保同
2014级计算机菁英班
1/6/2017 1
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