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sire design power calculation for qtl mapping experiments陛下对qtl定位的实验设计能力计算.pdfVIP

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sire design power calculation for qtl mapping experiments陛下对qtl定位的实验设计能力计算

Note Sire design power calculation for QTL mapping experiments Antonello Cartaa Jean-Michel Elsen a Istituto Zootecnico e Caseario 1a per Sardegna, Bonassai, 07040 Olmedo (SS), Italy b Station d’amélioration génétique des animaux, Inra, BP 27, 31326 Castanet-Tolosan cedex, France (Received 25 May 1998; accepted 2 February 1999) Abstract - Estimates of sire design power for QTL mapping experiments obtained using three different methods of algebraic approximation were analysed by comparing them with the results of data simulations. Even when the binomial probability that any number of sires out of the total number of sires are jointly heterozygous at the marker and the QT loci was taken into consideration, the algebraic approximations overestimated powers. However, they could be used to rank designs differing in the number of sires if the total size of the experiment is given. The results were discussed, focusing on the assumptions made about the number of informative offspring, the balance between the two offspring sub-groups which receive the same marker allele from the sire and the distribution of the statistic. Given that a full algebraic approach would be computationally costly, data simulation can be considered a useful tool in estimating the power of QTL detection sire designs. copy; Inra/Elsevier, Paris QTL/ power/ simulation/ protocol design Résumé - Calcul de la puissance de détection de QTL dans un modèle « père ». Trois méthodes analytiques pour l’estimation de la puissance du protocole fille pour la détection des (!TLs à l’aide d’un marqueur flanquant ont été étudiées en comparaison avec des résultats ob

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