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质粒DNA 的提取及酶切
质粒DNA 的提取及酶切 实验原理 实验仪器 实验试剂 实验步骤 注意事项 实验原理 在pH 12.0 ~ 12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。 限制性内切酶在一定的条件下对DNA特异序列进行切割。 实验仪器 1 .恒温培养箱 2 .恒温摇床 3 .台式离心机,最高转速14000g 4 .高压灭菌锅 5 .水浴锅 6 .电泳仪 7 .电泳槽 实验试剂 1.溶液Ⅰ 2.溶液Ⅱ 3.溶液Ⅲ 4.结合缓冲液 5.浓缩漂洗液 6.洗脱缓冲液 7.离心吸附柱 8.废液收集管 实验步骤 (一)提取质粒 1. 将2 mL 含Amp ( 50 μg/mL )的LB 液体培养基加入到试管中,接人上述的含pTOPⅡ 质粒 的大肠杆菌,37 ℃ 振荡培养过夜。 2 .取1.5 mL 培养物倒人微量离心管中,1200rpm/min 离心 1 min 3 .吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。 4 .将细菌沉淀悬浮于100μL 溶液I中,充分混匀,vertex。 5 .加150μL 溶液Ⅱ,立即温和颠倒离心管数次,使菌体充分裂解,裂解后的菌体变的清凉。随 后将离心管放置冰上1-2min(时间勿超!) 6. 加人150μL溶液Ⅲ,立即温和颠倒离心管数次,将离心管室温放置5 min 。12000rpm离心 12min。 7. 将420μL结合缓冲液加入离心吸附柱中,然后将步骤3中的上清加入离心吸附柱中(尽量去除 杂质),混匀,12000rpm离心30s。倒掉废液收集管中的废液。 8. 加入750μL漂洗液于离心吸附柱中,静置1min后,12000rpm离心15s。倒掉废液收集管中的 废 液。重复一次。倒掉废液后。再次于1200rpm/min 离心 2 min,尽量除去漂洗液。 9. 小心取出离心吸附柱,将其套入一个干净的1.5ml Eppendorf 离心管中,加入50μL无菌水, 室温放置2-5min后,1200rpm/min 离心 1 min。 -20 ℃ 保存。 (二)酶切 酶切反应体系(20μL): ddH2O 16μL 10×Buffer R 2μL HindⅢ 1μL 质粒 1μL Total 20μL 37℃ 保温2h ,凝胶电泳观察实验结果 注意事项 质粒检测: 电泳检测:质粒电泳一般有三条带,分别为质粒的超螺旋、开环、线型三种构型。 吸光值检测:采用分光光度计检测260nm、280nm波长吸光值,若吸光值260nm/280nm的比值介于1.7-1.9之间,说明质粒质量较好,1.8为最佳,低于1.8说明有蛋白质污染,大于1.8说明有RNA污染。 * * 内蒙古农业大学生物化学与分子生物学实验教学中心 制作人:李国婧
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