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《生物信息学》大作业参考模板-2016
《生物信息学》大作业
参考答案
芍药ACS 基因的生物信息学分析
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2016 年4 月11 日
一、芍药ACS 基因序列及其编码的蛋白的功能
乙烯是存在于植物体内的唯一的一种气态植物激素,调控植物花、果和叶片的衰老进程。乙烯的合成
主要在转录水平上受到ACS (ACC synthase ,ACC 合酶)和ACC 氧化酶的调控,ACS 将SAM (S-adenosyl
methionine ,S-腺苷甲硫氨酸)转化为ACC ,ACC 氧化酶进一步将ACC 转化为乙烯。(3 分)
本作业的研究材料为芍药ACS (ACC synthase )基因,NCBI 序列号为JX512359 ,其核苷酸序列及编
码的氨基酸序列如图 1。(5 分)
acatggggacagcatacgcaataaaagcaataccaaacttcctt 44
taaatctgcttctgctattcgatcatcattgttacattcttctctacaaacctcctctgttttttcttcaaatttctatagtcacataaa 134
ATGGGATTCATGTCCACAGATCAACAAAAGCAATTGCTGTCAAAGATGGCAACAGGCAATGGCCATGGAGAAGACTCTCCTTACTTTGAT 224
M G F M S T D Q Q K Q L L S K M A T G N G H G E D S P Y F D 30
GGTTGGAAGGCATATGACAGCAATCCATTTCATCTTAATAACAATCCTAATGGGGTTATCCAAATGGGACTTGTAGAAAATCTGCTTTCC 314
G W K A Y D S N P F H L N N N P N G V I Q M G L V E N L L S 60
TTTGATGTGATTCAAGAATGGGTTCTGAATAATCCAAAAGCCTCCATTTGCACGCCAGAAGGAATTAATGAATTCAGAGATACTGCTATT 404
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