- 1、本文档共44页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
分子设计原理精要
分子设计原理精要
(试用本)
杨新玲、路慧哲、开振鹏
中国农业大学 应用化学系
二零零五年十月
PDF 文件使用 pdfFactory Pro 试用版本创建
前言
理论分析、实验测定以及模拟计算已经成为现代科学研究的三种主要方法。20 世纪90
年代以来,由于计算机科学和技术的飞速发展,模拟计算的地位日渐突出。在新药以及新材
料的研究和开发中,采用分子模拟技术,从分子的微观性质推算、预测药品及材料的各种介
观、宏观性质,已成为新兴学术的发展方向。
化学家的主要 务是合成和创造出具有理想性能的化合物。社会大都对只具有美丽的化
学结构的化合物不感兴趣,其主要关注于这些结构具有何种有用性质。化学工业只能销售化
合物的性质。但是,人们却只有通过改变化合物的结构才能达到改变性质的目的。这样,化
学研究的一个最基本的任务就是对结构于性能的关系进行推导。目前,人们大多倾向于采用
计算机进行此项研究 例如QSAR 、QSPR)。因此,就需要将各类结构的信息计算机化;这
即是分子模拟的强项;同时分子模拟还可以帮助我们了解更多的结构的、化学反应的信息,
使我们对化学有一个更深、更清晰的认识。例如,通过计算我们可以了解反应的历程,过渡
态的信息等,这些在通常的化学实验中是不容易 到的。
在介绍本书之前,我想应该使大家对分子模拟的概念有一个较为清楚的认识。分子模拟
是研究各种分子生成,描绘和操作各种分子结构及其化学反应,以及研究各种源于分子三维
结构的性质的一门技术。 Molecular modeling is a technique for deriving, representing and
manipulating the structures and reactions of molecules, and those properties that are dependent on
these three dimensional structure. )另外,讲到模拟就不 不讲模型。盖大楼之前要做模型,
造飞机要做模型,就连玩具在投产之前也要做模型。但是本书讲的模型和前三者不一样,它
不能理解为用木头、塑料或纸张做成的实物模型;也不是计算机模拟出来的图形;而是描述
2 2
分子、原子、电子等运动的数学表达式,它是 “活”的。它也不像x=3, x +y = 10 那么简单,
是很复杂的,比如量子力学基本的薛定锷方程。
本书简要叙述了分子模拟以及药物设计相关的基础理论问题。本书论及的是一个交叉学
科领域,涉及的基础知识比较多。这些内容不可能在本书中一一介绍,感兴趣的读者请阅读
其他相关文献。本书第一章由路慧哲老师执笔,其余部分由开振鹏同学完成,全书由杨新玲
教授定稿。另外陈 同学参与了本书的编辑工作。
我在中国农业大学读书的六年多来,杨新玲教授、凌云副教授、陈馥衡先生以及农大的
很多老师给了我很大的指导和帮助,在此向他们表示衷心地感谢。我在大三时有幸聆听了清
华大学张复实教授的结构化学,他为我打开了神奇的结构世界的大门,让我在以后的岁月里
能够投身分子模拟以及分子设计的研究。我还要感谢中科院研究生院的颜达予先生和中科院
文档评论(0)