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China Biotechnology ,2016 ,36 (4 ):
中国生物工程杂志 69-77
DOI :10. 13523 /j. cb.
镉胁迫下麻疯树转录组测序分析*
苏稚喆 王雪华 杨 华 孙 焕 魏 炜**
(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 成都 610064)
,
摘要 麻疯树是一种能适应多种恶劣环境条件的能源植物 目前关于其抵抗重金属胁迫的分子
。 、
调控机理尚不清楚 从组学水平整体分析其基因表达模式对于筛选关键基因 解析镉胁迫响应
。 Illumina (Cd
调控网络和促进分子育种具有重要意义 利用 测序技术对水培条件下培养的处理组
100) (CK) , de novo
和对照组 麻疯树幼苗叶的转录组进行高通量测序 两个数据库的测序数据经
50448 Unigene 。 2551 , 539
组装得到 条高质量的 两个样品中发现了 条差异表达基因 其中 条上调
,2012 。 ,
基因 条下调基因 根据不同数据库的注释信息 发现麻疯树镉胁迫引起叶片中多种代谢途
, , , 。DAVID
径的变化 包括碳代谢 光合作用 植物激素信号转导以及植物病原响应途径 分析显示
, Na
镉胁迫引起了麻疯树叶中与离子转运相关基因的变化 导致叶片中 离子和铁离子稳态的变
。 WRKY ZIP 。 qRT-PCR
化 转录因子分析发现 和 在镉胁迫中发挥重要作用 用 技术对随机挑选的
5 , , 。
个基因进行荧光定量验证 结果与测序数据一致 证实了差异表达基因数据的有效性 深入探
, 。
讨了麻疯树镉胁迫的分子机理 为进一步应用于基因工程和植物修复提供基础
关键词 麻疯树 转录组 镉胁迫 植物修复
中图分类号 Q789
、 ,
重金属污染是当今世界上普遍关注的环境问题之 树是一种经济节约 环境友好型的资源植物 其用途广
, , (Cadmium ,Cd) , , 。
一 在重金属污染中 镉 是毒性最强和 泛 综合利用价值高 近年来已成为社会关注的焦点
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