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32 1 Vol ． 32 No ． 1
卷 期 中 国 生 物 医 学 工 程 学 报
February 20 13
20 13 2 Chinese Journal of Biomedical Eng ineering
年 月
运用近邻传播聚类分析进行SELDI-TOF 蛋白质谱特征选择
1 1 1 1* 2 2
杨合龙 祝 磊 韩 斌 厉力华 郑智国 孟旭莉
1 ( ， 3 100 18 )
杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院 杭州
2 ( ， 3 10022 )
浙江省肿瘤研究所 杭州
: SELDI-TOF ，
摘 要 针对如何有效分析高通量 质谱数据以及筛选与肿瘤相关的蛋白质位点 提出一种基于近邻传
。 t-test SELDI ，
播聚类分析的特征选择方法 首先利用 对 数据进行初筛 然后利用近邻传播聚类分析以及零空间
LDA ， SVM-RFE ， 。
对数据进行降维和去相关处理 最后采用 进行特征选择 筛选出与肿瘤判别相关的蛋白质位点 利
SVM 、KNN 、NB J4 . 8 4 ， 。 ， OC-WCX2 a OC-
用 及 等 个分类器 估算算法的分类性能 结果表明 在卵巢癌公共数据集 和
WCX2b BC-WCX2 a ， 3
以及浙江省肿瘤医院乳腺癌数据集 上显示该算法 在上述 个数据集中分类率分别达到
96. 43 % 、99. 66 % 、90. 88% ， 97. 00 % 、100 % 、96. 17 % ， 95. 85 % 、99. 08% 、8 1. 92 % ，
敏感性分别达到
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