第3章-3.3_分子模拟方法.pdf

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第3章-3.3_分子模拟方法

2013/9/15 1 化学中的模型 化学模型大的方面可以分为两种:宏观模 第三章分子模拟 型和微观模型。 宏观模型如化工物料流模拟(虚拟化工设 计) ; 微观模型也叫原子模型或分子模型,它有 两个方面的含义:计算化学和构效关系。 孔德信 2013年9月15 日 本章主要讨论计算化学。 计算化学 分子模拟理论计算方法分类 也称为分子模拟,它是指应用已有的理论化 Computional Methods 学、力学定律包括牛顿力学和量子力学等,借助 计算机定量地预测一些难以通过实验方法测定的 Quantum Mechanical Methods 结构信息,如电子的运动状态,净电荷的分布, 原子的部分电荷等,预测分子的性质、反应。 Molecular Mechanical Methods 利用分子模拟可以确定化合物的系统能量以 Semiempirical Methods 及对应的稳定构象、静电势面、键长和键角、旋 Ab Initio Methods MM+ 转能垒以及分子集合体的某些热力学性质,包括 AMBER BIO+ 熵、自由能、热容、平衡常数,结合能等。分子 OPLS INDO HF MNDO 模拟是当今化学家、材料科学家、药物化学家手 ... AM1 B3LYP 中一种得力的工具。 PM3 MP2 ... ... 2 量子化学

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