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- 2017-09-23 发布于天津
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红尾蚺和原矛头蝮基因组微卫星分布特征比较分析 - 四川动物.PDF
DOI:10.11984/j.issn.1000-7083
红尾蚺和原矛头蝮基因组微卫星分布特征比较分析
聂虎, 曹莎莎, 赵明朗, 杜林方*
( 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘要:本研究分析比较了红尾蚺Boa constrictor 和原矛头蝮Protobothrops mucrosquamatus 基因组完美型微卫星的分布特征,通过
MISA 工具分别鉴定出398 860 个和422 364 个微卫星,其总长分别为8 550 741 bp 和12 243 226 bp,分别占基因组大小的0.59%和0.73%,
在各自基因组中的丰度分别为275.46 个/Mbp 和252.33 个/Mbp 。红尾蚺基因组中单碱基重复类型微卫星最多,其次是四碱基、二碱基、
三碱基、五碱基和六碱基,最丰富的5 种微卫星类型是A 、AC 、AAAT 、AG 、AAT ;原矛头蝮基因组中单碱基重复类型微卫星最多,其
次是三碱基、四碱基、二碱基、五碱基和六碱基,最丰富
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