利用微卫星标帜进行台湾水牛保种族群遗传变异分析-中国畜牧学会.PDFVIP

中國畜牧學會會誌，42(4) ：275~294, 2013  利用微衛星標幟進行臺灣水牛保種族群遺傳 變異分析 (1) 林德育(2) 賴芳裕(3) 魏良原(4) 郭曉芸(4) 涂柏安(5) 賴永裕(2) 吳明哲(2) 王佩華(3)(6) 摘要：近年來臺灣水牛由於數目的銳減，在國內已屬保種家畜。為維持其族群 之遺傳多態性，及未來可能進行域外保育，了解圈養於畜產試驗所花蓮種畜繁 殖場之保種族群遺傳結構現況，為避免發生近親繁殖的重要課題。本試驗利用 12 組微衛星標幟，進行花蓮種畜繁殖場臺灣水牛保種族群檢測，以探討場內臺 灣水牛族群結構。試驗結果顯示，此 12 組微衛星標幟進行族群遺傳分析，所 得之平均每基因座交替基因數目（N ）為 4.3 個、平均有效基因座數目（N ） a e 為 2.5 個；平均期望異質度（HE ）與觀測異質度（HO ）值分別為 0.532 與 0.505 ； 平均的多態性訊息含量 （PIC ）及懷特氏固定指數 （FIS ）值分別為 0.48 及 0.043 。 但進一步篩除 CSSM45 及 CSSME070 兩個低多態性微衛星標幟，以其餘 10 個 微衛星標幟組檢測所得平均 HO 、HE 、PIC 及個體鑑別率（PID ）值，將分別由 -8 -8 0.505 、0.532 、0.480 及 6.99× 10 提高至 0.590 、0.622 、0.561 及 9.71× 10 。利用 12 組微衛星標幟檢測基因型，配合 STRUCTURE 軟體分析，臺灣水牛保種族 群可分為 3 次族群，另外 UPGMA 親源關係樹結果顯示，第一與第三兩次族群 間有顯著分化情況（bootstrap value = 100 ），第二次族群與第一、三次族群間 則無顯著分化的情況；以 POSA 方法檢測所得之族群個體親源關係樹亦呈現相 似的結果。利用此 12 組微衛星標幟檢測結果，反映出場內臺灣水牛初始族群 小、外來種原少之特色。惟由 FIS 值檢定結果顯示，場內臺灣水牛保種族群尚 無嚴重近親配種情況（FIS =0.043, P ＞ 0.05 ），雖然族群已產生些微分化，此 或許可能反映近年來場方有以特定個體進行配對配種之結果。綜合上述結果， 未來應可利用本試驗 10 組微衛星標幟，檢測場內保種族群、推測系譜及分析 場內個體間之遺傳關係，及場內個體配種之參考。進一步亦可配合場外採樣， 進行場外臺灣水牛族群分析，並規劃野放或野外引種等措施，以利同時維持圈 養與野外族群之遺傳多態性，達成域外保育之目的。 (關鍵語：保種族群、微衛星標幟、族群結構、沼澤型水牛、臺灣水牛） (1)行政院農業委員會畜產試驗所研究報告 1868號。 (2)行政院農業委員會畜產試驗所遺傳育種組，71246 臺南市新化區牧場路 112 號。 (3)國立臺灣大學動物科學技術學系，10673 臺北市基隆路三段 155 巷 50 號。 (4)行政院農業委員會畜產試驗所花蓮種畜繁殖場，97362 花蓮縣吉安鄉干城村 25 號。 (5)行政院農業委員會畜產試驗所恆春分所，94644 屏東縣恆春鎮牧場 1 號。 (6)通訊作者，E-mail: demonwang@.tw 276 中國畜牧學會會誌 第 42 卷 第 4 期  緒