量子化学的应用.doc

研究生课程论文 量 子 化 学 应 用 课程名称 量 子 化 学 姓 名 马 建 华 学 号 0900202003 专 业 无 机 化 学 任课教师 曹 学 功 开课时间 2010.3 - 2010.7 教师评阅意见： 论文成绩 评阅日期 课程论文提交时间：2010 年7 月8 日 量子化学的应用 马建华 华侨大学材料学院2009级研究生班 学号0900202003 摘要：本文章概括地总结了2008年来量子化学的理论和应用研究进展, 同时简要介绍了其在材料学、生物学、基础化学研究中的应用。 关键词：量子化学；计算方法；应用 1、前言 量子化学是理论化学的一个分支学科，是将量子力学的原理和方法应用到化学问题研究中而产生的一门学科，经过化学家们的努力，量子化学理论和计算方法在近几十年来取得了很大的发展，在定性和定量地阐明许多分子、原子和电子尺度级问题上已经受到足够的重视。目前，量子化学已被广泛应用于化学的各个分支以及生物、医药、材料、环境、能源、军事等领域，取得了丰富的理论成果，并对实际工作起到了很好的指导作用。 量子化学可分基础研究和应用研究两大类，基础研究主要是寻求量子化学中的自身规律，应用研究是利用量子化学方法处理化学问题，用量子化学的结果解释化学现象。 2、量子化学的应用 80年代以来，随着计算机和大型工作站的出现以及有关量子化学计算软件的大量推出（例如GSMESS系列，HONDO系列，GAUSSIAN系列等程序包的推出），使量子化学计算方法成为化学计算理论研究的主流。量子化学计算方法可用于解释或预测原子，分子和晶体的各种性质，包括分子的能量和结构，化学反应路径，过渡态的能量和结构，分子轨道，原子电荷，成健和化学反应能量，极化率和超极化率，各向异性超精细耦合常数，静电势以及电子密度等。其应用范围也不断扩大，涉及到化学各分支学科，并取得了可喜的成果。下面主要讲述的是2008年来量子化学应用研究的进展。 2.1在有机金属材料中的应用 金属有机材料，是一种典型的纳米多孔材料，在化学吸附和化学分离技术等方面比传统的纳米材料存在许多潜在的优点。量子化学计算方法应用于这一领域，用以研究MOFs的结构和电子性质[1]。近年来引起了的广泛注意，得到了迅速的发展。 D. F. Bahr和C. A. Bauer等[2]根据密度泛函理论（DFT）对立方羧酸锌单晶的弹性性能进行计算，分别采用了局域密度近似(LDA)计算方法和广义梯度近似(GGA)计算方法。结果算的密度泛函理论值(LDA-GGA平均值)为E = 21.6 ± 0.3 GPa, C11 = 0.28 ± 0.01 GPa, C12 = 0.11 ± 0.01 GPa以及C44 = 0.03 ± 0.02 GPa。C44预示着IRMOF-1结构的不稳定，同时，GGA预测出较大的晶格常数，将导致其较小的弹性常数。将密度泛函理论（DFT）计算出的弹性系数与通过纳米压膜测量的金属有机材料的弹性塑性响应结果相比较，杨氏模值较密度泛函理论（DFT）Samanta等[3]使用DFT-LDA和更为精确的PAW方法进行计算，得到显著不同的结果，尤其是他们发现了一个小值的模量C44，预示着这种MOFs结构的不稳定性。其后，ZhouYildirim等[4]人报道了使用DFT-LDA计算得出的IRMOF-1的弹性常数值及其通过计算与测量得出的振动特性。他们证实了Samanta等发现的小值模量C44。他们的测量和计算中子非弹性散射结果基本上支持了通过DFT-LDA计算得出的弹性性能。计算得出的点阵参数也十分接近通过中子衍射实验所得出的测量值。 2.2在生物化学中的应用 量子化学计算方法主要应用在了解大幅度构象变化的机理，设计高效、高选择性的药物分子等方面。在过去的二十年里，量子力学/分子力学（QM/MM）Jerry M. Parks等[5]发展并使用从头计算法和密度泛函理论（DFT）QM/MM(2Z)-2-(benzoylamino)-3-[4-(2-bromophenoxy)phenyl]-2-propenoate在丙型肝炎病毒聚合酶结合处的配体结合模式，成功地鉴定出在最初的20个对接位点(docked poses)中，相对于晶体结构来说，有三个对接位点有较小的RMSD值。同时把许多蛋白质配体复合物的能量分解成为配体的量子极化内能，QM/MM van der Waals以及QM/MM静电能，以此观察全部能量和它的组成部分是如何在配体最优与次优的构型中转化的。结果发现，内能决定了对接位点(docked poses)的能量排序，有利于其中三个对接位点。实验表明，引入溶剂效应