分子生物学技术在环境微生物多相分类中的应用.PDF

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分子生物学技术在环境微生物多相分类中的应用

第 卷第 期 苏 州 科 技 学 院 学 报 自然 科 学 版 ! 8 7 9 Q./#! (.#8 年 月 %%8 ! R.SFD/ .T UD@VKF?@B; .T IA@KDAK DW XKA=D./.J; .T ISY=.S 7(BSF/ IA@KDAK9 ’KA# %%8 分子生物学技术 在环境微生物多相分类中的应用 ! ! 叶亚新 ,黄 勇 ,王金虎 ( 苏州科技学院 生物系,江苏 苏州 ; 苏州科技学院 环境科学与工程系,江苏 苏州 ) !# !$%% # !$% !! 摘 要:概述了分子生物学技术包括 ( ) 的测定、核酸杂交、分子标记技术、蛋白质技 ’() *+, -./0 术等在环境微生物多相分类中的应用,分析了各项技术的优缺点,介绍了最新进展和发展的方向。 关键词:环境微生物;多相分类;分子生物学技术;应用 中图分类号: 文献标识码: 文章编号: 12 ) !345%3647%%89%85%%835%6 环境微生物学注重微生物和环境之间相互作用的规律、微生物活动对环境和人类产生的 有益和有害的影响以及在环境污染控制工程中有关的微生物学原理的研究,其中对环境中微 生物种群的类型和数量进行及时准确的分析测定尤显重要。目前在微生物学领域,研究各级分 类单元的最有效手段是多相分类( ),该法能较为客观地反映生物间自然系 :./;=?@A BC.D.-; 统进化的关系,涉及的数据包括表型类、基因型类和系统发育类。表型信息包括:形态、生理生 化性状的分析等,属于传统研究范畴;基因型信息包括:细胞’() 或E() 分子的分析,在此涉 及许多分子生物学技术,包括 的( ) 、 分子杂交、 分子杂 ’() *+, -./0 ’()5’() ’()5FE() 交、分子标记技术如 、 、 等,这些已成为现代微生物分类的主导方法。而系统 EGH: E):’ II,: 发育标记( )以一些基因片断如 为分析对象,结合其他分类信息, :=;/.JKDKB@A LFMKF? !3IFE() 可将细菌的遗传关系及分类单元确定到科、属、种等不同的等级。现就分子生物学技术及其在 后两类的研究应用情况作一综述。 ! 核酸分析 中( ) 测定 !! #$% ’( )*+ , 每种微生物的’() 均有特定的7*+,9 -./0 ,而且较稳定,不受菌龄和外界环境的影响,所 以是理想的分类指标。目前在微生物分类研究中, 值是应用最普遍的分子指标之一。需要 7*+,9 注意的是,单纯根据7*+,9 -./0判断,数值相同或相近的菌株未必种类相同或相近,而数值不 同者,肯定不会是同种或相近属种,所以7*+,9 -./0应与表型特征或其它分类依据结合起来分 N!O 析 。 !- 核酸杂交 用分子杂交技术可以发现核酸分子的同源序列,生物间亲缘关系越近,其间的’()P ’() ——————————————— 收稿日期: %%85%25%2 作者简介:叶亚

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