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讲化学结构绘图)
第三讲 化学结构绘制软件ACD/ChemSketch 一、ACD/ChemSketch基础 二、画简单的结构 三、画复杂的结构 四、超级结构和化学反应式 五、高级画法:模型 六、画反应装置 一、ACD/ChemSketch基础 1.启动ACD/ChemSketch 2.设定可兼容的文件类型 3. ChemSketch的工作界面 1.启动ACD/ChemSketch 2.设定可兼容的文件类型 3. ChemSketch的工作界面 结构模式的工作界面(默认) 画图模式的工作界面 结构模式的工作界面 标题栏(Title bar) 菜单栏(Menu bar) 通用工具条(General toolbar)同结构模式。 编辑工具条(Editing toolbar) – 位于通用工具条的下面, 只适用于画图模式,包括编辑动画物体的功能键. 画图工具条(Drawing toolbar)包括画各种物体和文字的功能键. 工作区域(Workspace)- 在中间的区域, 图画与文字将在这里显示. 调色板(Color Palette) 用来将物体等涂上颜色,(只要在相应的颜色上点击即可). 状态栏(Status bar) -显示对当时状态有用的信息: 打开的SK2文件名和 SK2文件的页码等. 二、画简单的结构 常用工具介绍: 常用画图工具 连续画图工具 画链工具 在立体结构中, 远离你的键 在立体结构中,指向你的键 配位键 非定义键 翻转工具 编辑原子标签工具 改变位置(Change Position) 1.使用常用画图工具 例1 画出结构 2.使用连续画图工具 3.使用立体键、配位键和非定义化学键工具 在立体结构中, 远离你的键 在立体结构中, 指向你的键 配位键 非定义键 4.编辑原子标签 5.使用画链工具 6.翻转结构 7.选择、旋转和3D旋转 选择原子、化学键和图象,两种方法 套索选择 (Lasso Selector) 矩形选择 (Rectangle Selector) 旋转、删除等状态下,在一个结构的旁边点击也可以选中该结构 一旦选择了图象,有三种移动方式: 移动 (Move):也可以使用其拉动原子以改变位置 旋转/调整 (Rotate/re-size) 3D旋转 (3D Rotate) 或进行其他操作: 删除 (Delete) 3D 优化 (3D Optimization) 2D 优化 ,或清理(2D Optimization,Clean) 三、画复杂的结构 1、如何用化学基团表画化学基团 2、如何迅速地画环结构 3、如何画原子的电荷、阳离子和阴离子 4、如何改变不同原子的性能 1、如何用化学基团表画化学基团 2、如何迅速地画环结构 3、如何画原子的电荷、阳离子和阴离子 4、如何改变不同原子的性能 * 两种启动方法:(1)从桌面双击图标启动 (2)从开始菜单启动:开始/所有程序 /ACDlabs FreeWare 5.0/ChemSketch 注:(1)免费版本弹出一个对话框ACD/Labs Products,点击OK或直接关闭。 (2)ACD/ChemSketch包括两个软件,3D Viewer(3D视图)和 ChemSketch, 在3D Viewer中可以看到绘制好的分子式的空间结构。 (1) 在第一次使用此软件时, 设定可兼容的文件类型(File Associations)对话框将出现. (2)这些可兼容的形式包括CS ChemDraw(*.CHM), REACCS Rxnfiles (*.RXN), ISIS/Sketch (*.SKC) , 可能还有其他格式的文件, 这些文件都可以在ChemSketch 中打开. 具体做法是在想要添加的选项前的方框内点上对号, 然后点击YES键即可。 (3)如果不知道或者不确切地知道 ChemSketch将打开的文件的扩展名, 不要选任何选项, 然后点击NO键。 (4)然后今日诀窍(Tip of the Day)窗口将跳出, 可以在阅读结束后关闭 。 标题栏(Title bar) 菜单栏(Menu bar) 通用工具条(General toolbar)-在菜单键的下面, 包括那些在结构和画图模式中都会用到的通用键, 如:保存文件, 打开文件, 取消/重做操作, 拷贝和粘贴, 扩大与缩小, 以及插入不同的模块。 ChemBasic 功能键(ChemBasic toolbar) -在一般功能键的下面, 它们是
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