gephi始肮用交流.pptx

Gephi使用交流@uestc黄盼华互联网科学中心2014年10月25日星期六概要简介安装输入数据功能细节预览导出功能区插件库示例其它可视化软件简介开源的网络可视化平台用途：探索性的数据分析，链接分析，社交网络分析，生物学网分析功能：组合，多种布局方式，可交互，分割，排序，基本指标，含时变化，过滤限制：10万个结点（数据存储在内存中），稳定性，中文视频教程： /gephi/gephiGephi.mp4Gephi.mp4 或/v_show/id_XNDgyNDgxNzg4.html?tpa=dW5pb25faWQ9MjAwMDA4XzEwMDAwM18wMV8wMQ优酷在线 或/watch?v=bXCBh6QH5W0YouTube安装可用在Windows、Linux、Mac上需要jre或者jdk环境（jdk=1.7）手动配置方法：在C:\Program Files (x86)\Gephi-0.8.2\etc\gephi.conf 中添加jdkhome=“/path/to/jdk”，譬如我的是jdkhome=D:\Program Files\Java\jre7输入数据自行输入结点和连边从文本文件导入：需在首行输入标签，字段间的分隔符可为逗号、分号、tab、空格。连边标签标签说明备注Source起点必需Target终点必需Type网络类型（Directed/Undirected）可空，默认为有向Weight边权重可空，默认为1自定义….??结点标签标签说明备注Id结点编号可空Label标签可空自定义…生成随机图：gephi自带功能，可指定节点数，连边概率打开其它格式文件：.dl .dot .gv .gdf .gexf .gml从数据库导入实时网页浏览记录导入邮箱数据：导入本地eml文件，或配置接收服务器类型自动下载功能细节可交互：选择指定的结点/边；计算基本指标：度、网络直径、hits、pr、模块度、连通组件、聚类系数、特征向量中心性、平均路径长度；分割：分割结点/边，赋以不同颜色；排序：排序结点/边，赋以不同的颜色/大小/标签颜色/标签大小；多种布局方式：考虑结点间的引力和斥力；过滤：可定义多个过滤器（Operators），选择特定的结点/边（Attributes/Edges），选择符合特定拓扑逻辑的子网（Topology）；导出到新的工作区（workspace）组合(Group)：选择特定的结点，右键选Group；含时变化：预览导出Nodes：Node labels：显示结点标签Edges：显示边，调节边权重Edge labels：导出：.svg，.pdf，.png调节背景颜色功能区下侧：显示结点标签显示连边连边赋以source结点的颜色显示连边标签调节连边权重大小策略：fixed，scaled，Node size颜色策略：unique，object字体字体大小调节器默认颜色结点和连边的标签内容：id、label等左侧：全屏显示选择：选择指定结点；框选：可用于组合（Group）；拖拽：拖拽结点的位置；颜色调节器：点选结点，改变结点颜色；大小调节器：点选结点，同时上下移动；颜色调节器2：点选结点，改变结点及最近邻居的颜色；添加结点：点击即增加结点；添加连边：点选source和target即增加连边；最短路径：点选source和target，显示最短路径；热度图：点选结点，按距离显示邻居结点的颜色；结点编辑：编辑结点属性；居中显示重置结点和连边颜色重置结点大小重置标签颜色重置标签可见性重置标签大小插件库类似于eclipse/netbeans的插件市场GeoLayout：可输入经纬度数据MapOfCountries：国家地图更多：/示例：创建Http GraphFile-Generate-HTTP Graph然后在浏览器中设置浏览器代理为:8088其它可视化软件Excel、OriginGraphviz、Networkx（Python的第三方库）Gephi（复杂网络可视化，免费）、Tableau（可视化数据分析软件，收费，无破解）、TillMill（地图制图可视化）Cytoscape、Igraph、Pajek、Snap、NodexlOrange Canvas（可视化的数据挖掘工具）、weka