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品种间标准遗传距离
山西省六个地方羊品种微卫星位点多态性研究 组员 :林树欣 林志明 刘江涛 刘智宏 陆晓桦 罗巧玲 苏 淇 覃金海 温永恒 温馨 刘丽文 报告人:温馨 前 言 世界自然保护联盟颁布的《2007受威胁物种红色名录》,全球目前有163.6种动植物面临灭绝危机,比2006年又增加了188种,占了所评估的全部物种的近40%。 山西省是一个养羊大省,绵山羊存栏数量多,地方品种遗传资源十分丰富,但目前一些地方品种正在逐步消失或数量急剧下降,开展资源保护工作显得十分重要。 微卫星 微卫星:是近年来发展起来的一种新型分子遗传标记,已被证实是度量品种遗传多态性、研究品种间遗传关系、估测品种间遗传距离及构建系统发生树的可靠分子遗传标记。 微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(simple tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,每个重复单元的长度在1-10bp之间。 微卫星位点可以提供具高分辨率的遗传信息,这一特点使微卫星既适合于个体水平上的研究,又适合于种群水平上的研究。 目的意义 通过用微卫星标记对山西省6 个地方绵、山羊品种DNA 多态性研究, 阐明其遗传结构特性, 为山西省地方绵、山羊品种资源的评价、保护和利用提供理论依据。 检测样品 检测样品采自各品种中心产区,每个品种随机采取品种特征明显的40 只羊的耳组织样品。 微卫星座位及引物序列 微卫星座位、引物序列、染色体位置等相关信息均来自 和http: // 引物由北京奥科生物技术有限公司合成 主要试剂 10 x buffer、dNT P、Mg2+ 、T aq酶、Tr is 平衡酚、丙烯酰胺等试剂均由太原市来宝生物工程有限公司提供; pBR322 DNA / Msp1 由天根生化科技有限公司提供。 实验步骤 结果与分析 实验结论 通过微卫星标记,揭示了群体遗传结构,目的是对物种资源做出正确的评估,提供理论依据。 最终,可以充分挖掘和利用我国特色物种资源。 参考文献 [ 1] 赵艳红, 何晓红. 中国6 个山羊群体微卫星标记的遗传多样性 分析[ J] . 畜牧兽医学报, 2007, 38( 1) : 20-24. [ 2] 王 杰, 陈明华. 四川9 个黑山羊品种( 群体) 微卫星DNA 多 态性研究[ J] . 畜牧兽医学报, 2006, 37( 11) , 1 124- 1 129. [ 3] 汪志国, 杨章平, 马月辉, 等. 长江中下游以及东南沿海的7 个 山羊群体的遗传多样性分析[ J ] . 畜牧兽医学报, 2006, 37( 1 ) , 1- 6. [ 4] 孙允东, 马月辉, 王建民, 等. 山东省地方山羊品种群微卫星基 因座的遗传多样性[ J] . 家畜生态学报, 2006, 27( 2) , 19-27. [ 5] 张英杰, 赵有璋, 刘月琴, 等. 微卫星DNA 标记在三个山羊品 种中的遗传多样性研究[ J] . 中国草食动物, 2003, 23( 4) : 7-8. [ 6] 吕效吾, 王业福. 山西家畜家禽品种志[ M ] . 上海: 华东师范大 学出版社, 1983: 88??109. [ 7] Barker J S F. A global prot ocol f or det ermining g eneti c dist ance am ong dom est ic livest ock b reeds[ J] . proc th WCGALP, 1994, 21: 501-508. [ 8] 孙飞舟. 采用微卫星DNA 标记评估中国地方猪种遗传多样性 [ D] . 北京: 中国农业大学, 2002, 69-70. 实验讨论 基因组DNA提取 用本实验改进的酚-氯仿抽提法提取羊耳组织基因组。 PCR 扩增的检测及分离 PCR反应结束后,用0.8—?1.0%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物。 对有效的扩增产物用8%—12%的丙烯酰胺凝胶电
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